بازسازی شبکههای ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو
عنوان مقاله: بازسازی شبکههای ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو
شناسه ملی مقاله: JR_NCMBJ-8-29_004
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_NCMBJ-8-29_004
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
سیده مهری جوادی - Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
زهرا سادات شبر - Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
آسا ابراهیمی - Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
مریم شهبازی - Department of Molecular physiology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
خلاصه مقاله:
سیده مهری جوادی - Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
زهرا سادات شبر - Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
آسا ابراهیمی - Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
مریم شهبازی - Department of Molecular physiology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی میباشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است.
مواد و روشها: تمامی ژنهای دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرمافزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهمکنش پروتئینی و شناسایی ژنهای کلیدی با استفاده از نرمافزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژنها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت.
یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهمکنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد.
بحث: براساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژنهای کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی میتوان به ژنهای عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5 و HYHاشاره کرد.
نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژنهای پاسخدهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهمترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش میباشند.
کلمات کلیدی: Barley, Drought stress, Biological network, Hub genes, گیاه جو, تنش خشکی, شبکههای زیستی, ژن هاب
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1162511/