مریم میدانسری - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده - استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
احسان شکری - کارشناس ارشد اصلاح نباتات، عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
حشمت الله رحیمیان - استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

پیشرفت های اخیر در زمینه مطالعات ژنومی، منجر به تولید انبوهی از ترادف بیان شونده ی نشاندار EST) در بسیاری از موجودات، بویژه گونه های گیاهی شده است. در این مطالعه با داده کاوی مجموعه ترادف های EST گزارش شده در ژن بانک NCBI، برای جنس آلوروپوس (Aeluropus)، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده (SSR) شناسایی شدند و در مرحله بعد پس از سنتز پرایمرهای مناسب توانایی تکثیر و ایجاد چندشکلی در برخی از اکوتیپ های گونه لیتورالیس (A.littoralis) ارزیابی شد. نتایج نشان داد که از مجموع EST, 611 مورد بررسی تعداد 44 مورد حاوی نواحی ریزماهواره هستند که از این تعداد در 20 مورد طول و شرایط نواحی مجاور موتیف های SSR برای طراحی پرایمر مناسب تشخیص داده شد. همچنین نتایج بدست آمده از تکثیر جفت پرایمرها با استفاده از DNA ژنومی اکوتیپ های مختلف نشان می دهد که تمامی پرایمرهای طراحی شده توانایی تکثیر در تمام اکتیپ ها ندارند و چند شکلی مشاهده شده در لوکوس های تکثیر شده، بخوبی بر تنوع نواحی عملکردی ژنوم دلالت دارد.

داده کاوی، ترادف بیان شونده ی نشاندار، آلوروپوس لیتورالیس، نشانگر EST-SSR