CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

شناسایی ژن های مهم در متابولیسم چربی با استفاده از آنالیز EST و آنالیز پروموتور این ژنها

عنوان مقاله: شناسایی ژن های مهم در متابولیسم چربی با استفاده از آنالیز EST و آنالیز پروموتور این ژنها
شناسه ملی مقاله: NBCI07_0037
منتشر شده در هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران در سال 1390
مشخصات نویسندگان مقاله:

محمدرضا بختیاری زاده - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح دام پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
محمد مرادی شهر بابک - استاد بخش ژنتیک و اصلاح دام پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
اسماعیل ابراهیمی - استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

خلاصه مقاله:
بافت چربی نقشی حیاتی و مهم در متابولیسم، ذخیره و آزادسازی اسیدهای چرب در پستانداران ایفا می کند. به منظور شناسایی ژن هایی که به طور اختصاصی در بافت چربی پستانداران بیان می شوند، نرم افزار (DDD) Digital Differential Display و سه پستاندار شامل انسان، خوک و گاو مورد بررسی قرار گرفت. از سایت COXPRESdb به منظور تایید نتایج حاصل از DDD بوسیله داده های ریز آرایه استفاده گردید. ژن های مشترک در بین این سه پستاندار شناسایی و آنالیز پروموتور این ژنها با استفاده از نرم افزار Pscan انجام شد. نتایج حاصل از DDD نشان داد که 65، 102 و 125 ترنسکریپت به ترتیب در انسان، خوک و گاو بیان بالاتر از 10 برابر در بافت چربی نسبت به بافت های دیگر دارند. از این تعداد در انسان، خوک و گاو به ترتیب 63، 49 و 81 ترنسکریپت مربوط به ژن های شناسایی شده و 2، 53 و 44 ترنسکریپت مربوط به کانتیگ های جدید بودند. با بررسی 63 ژن شناسایی شده بوسیله DDD در انسان در سایت COXPRESdb مشخص گردید که به ترتیب 39 و 29 ژن بیان بالاتر از یک و 2 برابر در بافت چربی دارند (در مبنای لگاریتمی 2). نتایج نشان داد که 7 ژن شامل DGAT2 ،LPL ،SCD ،ADIPOQ، FABP4، DGAT2، FASN و CIDEC به طور مشترک در بافت چربی این سه پستاندار بیان بالایی داشتند. آنالیز پروموتور مربوط به این هفت ژن در پروموتورهای انسانی منجر به شناسایی 6 مکان اتصالی عوامل رونویسی مشترک گردید. نتایج این مطالعه منجر به شناسایی یک TFBS جدید گردید که می تواند به عنوان یک کاندید جدید در متابولیسم چربی مورد بررسی قرار گرفته و افق جدیدی را در درک متابولیسم چربی با استفاده از ابزار بیولوژی محاسباتی باز نماید.

کلمات کلیدی:
بافت چربی، توالی بیان شده برچسب دار، پروموتور

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/375491/