متاژنومیکس خاک

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,070

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AEBSCONF02_089

تاریخ نمایه سازی: 16 خرداد 1394

چکیده مقاله:

میکروارگانیسم ها در محیط های طبیعی ممکن است شامل ژنهایی باشند که رمزگذار مسیرهای تجزیه و یا سنتز زیستی هستند. خاک یک منبع غنی از تنوع ژنتیکی است که پتانسیل زیادی را برای افزایش درک اکولوژی میکروبی و آنزیم ها و بیواکتیوهای مفید آنها برای جامعه بشری دارد با اینحال تنها درصد کمی از میکروارگانیزم های خاک قابل کشت هستند. در سالهای اخیر انواع روش های مختلف مولکولی و مستقل از کشت، برای جستجوی انواع میکروب ها صورت گرفته است یکی از این روشها بررسی متاژنوم (متاژنومیکس) می باشد. متاژنومیکس دانشی است که با استفاده از تکنولوژی های توالی یابی پیشرفته و نرم افزارهای بیوانفورماتیکی هوشمند، به بررسی تنوع عملکرد و فیلوژنی اجتماعات میکروبی در سطح جمعی و مستقل از کشت میپردازد. در حال حاضر، دانشمندان و پژوهشگران به یاری این دانش مدرن و جدید توانسته اند اقدامبه انجام پروژه های بسیار بزرگ نمایند که تا چند سال پیش تصور آن نیز غیرممکن بود. این تحقیق به بررسی استراترژیهای متاژنومیکس خاک، مطالعات جدید و چشماندازهای نوین در این زمینه پرداخته است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مریم سردابی

کارشناس ارشد بیوتکنولوژی میکروبی دانشگاه الزهرا

فاطمه نافیان دهکردی

دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی پزشکی دانشگاه تربیت مدرس

صاینه خدادادی

کارشناس ارشد میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Arrojo et al, . 2010). Metagenomic era for biocatalyst identificatio. ...
  • Brennerova et al, . 2009. Metagenomics reveals diversity and abundance ...
  • Cowan and Stafford. 2007. Metagenomic methods for the identification of ...
  • Daniel. 2004. The soil metagenome: a rich resource for the ...
  • Daniel. 2005. The metagenomics of soil. Nature Publishing Group 3: ...
  • Delmont et al, . 2011. Accessing the Soil Metagenome for ...
  • Delmont et al, . 2011. Metagenomic comparison of direct and ...
  • Eyers et al, . 2004. Environmentl genomics: exploring the unmined ...
  • Handelsman et al, . 2007. The New Science of Metagenomics: ...
  • Hawkins et al, 2002. Whole genome amplification applications and advance, ...
  • Hirsch et al, . 2010. Culture -independent molecular techniques for ...
  • Hosseini et al. 2010. An efficient annotation and gen e-expression ...
  • Iwai et al, . 2010). Gene -targeted -metagenomics reveals extensive ...
  • Jorgensen. 2008. Advances in monitoring of catabolic genes during bioremediatio. ...
  • Linhart and Shamir. 2002. The degenerate primer design problem. Bioinformatics ...
  • Lorenz and Eck. 2005. Metagenomics and industrial applications. Nature Reviews ...
  • Malik et al, . 2008. The uSe of molecular techniques ...
  • Mongodin et al, . 2005. Microbial metagenomics. Genome Biology 6:. ...
  • Rondon et a., . 2000. Cloning the Soil Metagenome: _ ...
  • Shendure and Ji. 2008. Next- generation DNA sequencing. Nature Biotechnology ...
  • Spits et al, . 2006. Whole-genome multiple displacement amplification from ...
  • نمایش کامل مراجع