تجزیه روابط ژنتیکی ارقام مرکبات اسیدی جنوب استان کرمان با تعیین توالی بخشی از ژنوم کلروپلاستی

بررسی های اجمالی در سال های اخیر نشان داده که بین ارقام و ژنوتیپ های مرکبات اسیدی بومی جنوب استان کرمان تنوع و تفاوت های مورفولوژیکی چشمگیری وجود دارد. این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی مرکبات اسیدی جمع آوری شده از منطقه و ارقام موجود درکلکسیون زنده مرکبات مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی جنوب استان کرمان انجام شد. استخراج دی ان ای از برگ 11 رقم مختلف مرکبات اسیدی شامل نارنج زینتی، نارنج محلی، نارنج دوفرم، لیمولیسبون، ماکروفیلا، رافلمون، لیموترش خوشه ای، ترنج، شادک مراکشی، بالنگ و لیموترش G5 به روش ژانگ و همکاران (1998) انجام گرفت. کمیت و کیفیت دی ان ای استحصالی به روش الکتروفورز و اسپکتروفتومتری بررسی شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از جفت آغازگرهای F55/R55 به منظور تکثیر بخشی از ژنوم کلروپلاستی انجام گرفت. در تمامی نمونه های مورد بررسی باندی به اندازه ی تقریبی 600 جفت باز تکثیر شد. قطعات دی ان ای تکثیر شده پس از تلخیص، تعیین توالی شده و تعلق آنها به ژنوم کلروپلاستی با استفاده از نرم افزار BLAST و جستجو در NCBI بررسی و تعیین شد. تجزیه مقایسه ای توالی های بدست آمده با استفاده از نرم افزار BioEdit و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با کمک نرم افزار MEGA5 مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج نشان داد که تعیین توالی قطعه تکثیر شده از ژنوم کلروپلاستی مرکبات به خوبی قادر به تمایز ارقام مختلف و تعیین قرابت آنها با یکدیگر می باشد.

کلیدواژه ها:

ژنوم کلروپلاستی ، قرابت ژنتیکی ، مرکبات اسیدی