بررسی سرولوژیک،مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی ویروس موزاییک خیار جداشده از گیاه شلغم در شهرستان رفسنجان ( کرمان)

ویروس موزاییک خیار عضو جنس Cucumovirus از خانواده ی Bromoviridae می باشد که دارای پیکره های ایزومتریک و ژنوم ssRNA تک رشته ای و مثبت است. این ویروس یکی از مهمترین ویروس های آلوده کننده ی گیاهان مختلف است و گسترده ترین دامنه ی میزبانی را در بین ویروس های گیاهی دارد. دراین پژوهش در سال زراعی 94-93 نمونه هایی از گیاه شلغم (Brassica napus) با علائم موزاییک در اطراف رفسنجان جمع آوری گردید. نمونه های جمع آوری شده توسط آزمون DAS-ELISA مورد بررسی قرار گرفتند. به منظور بررسی دقیق تر از روش RT-PCR استفاده شد. بدین منظور ابتدا استخراج RNA کل گیاه بااستفاده از دستور کار Column RNA isolation kit ( شرکت دنازیست ایران) انجام شد و وجود الودگی ویروسی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی پروتئین پوششی بررسی شد. نتایج حاصل از آزمون الایزا وجود آلودگی در نمونه هایی از گیاه شاغم را نشان داد. همچنین نتایج حاصل از آزمون RT-PCR نشان دهنده ی وجود یک قطعه ی 870 جفت بازی بود. محصول حاصل از PCR تعیین توالی گردید و توالی حاصل با استفاده از برنامه ی BLAST در پایگاه اطلاعاتی NCBI با ترادف های موجود در GenBank هم ردیف سازی و درصد شباهت ها و تفاوت ها بررسی شد. نتایج نشان داد که جدایه مورد بررسی از گیاه شلغم دارای 97% شباهت با استرین های HH-1 و SpK به ترتیب از چین و ایران می باشد. این اولین گزارش از ویروس موزاییک خیار در گیاه شلغم در استان کرمان است.

کلیدواژه ها:

ویروس موزاییک خیار ، شلغم ، الایزا ، RT-PCR