شناسایی و بررسی پروتئین های آرگونات موجود در پروتئوم لوبیا Phaseolus vulgaris
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,293
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_038
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
چکیده مقاله:
پروتئین های آرگونات به عنوان جزئی جدایی ناپذیر از تمام small RNA های شناخته شده می باشند که فعالیت برشی اندونکلئولیتیکی، برای بسیاری از آنها ثابت شده است.گیاه لوبیا یکی از چندین گیاهی می باشد که اخیرا تعیین توالی شده است و اطلاعات مربوط به ژنوم آن در دسترس می باشد، از این رو گزینه ی مناسبی برای اغلب تحقیقات بیوانفورماتیکی می باشد. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی پروتئین های آرگونات موجود در گیاه لوبیا با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی می باشد. ابتدا توالی های آمینواسیدی پروتئین های آرگونات گیاه لوبیا و آرابیدوپسیس از پایگاه اطلاعاتی مورد نظر دریافت شد، سپس با استفاده از نرم افزار clustalW همردیفی توالی های صورت گرفت، در ادامه با استفاده از نرم افزار boxshade نواحی حفظ شده این توالی ها به صورت ملموس تر نشان داده شد. سپس دامنه ها ، درخت فیلوژنی و ساختار سه بعدی برخی از این پروتئین ها مشخص شد و در انتها با استفاده از نرم افزارclc main workbench بررسی های بیشتری روی این پروتئین ها انجام شد. این تحقیق نشان داد که لوبیا دارای 16 پروتئین آرگونات می باشد ، پروتئین های آرگونات موجود در گیاه لوبیا به طور کلی دارای سه دامنه اصلی به نام های MID ،PAZ و PIWI می باشند و این پروتئین ها هنگام رسم درخت فیلوژنی در سه دسته مجزا قرار می گیرند که نشان از حفظ شدگی این پروتئین ها در گونه های مختلف گیاهی می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمد حسن شمسی فرد
دانشجویان کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان
خالد میرزایی
دانشجویان کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان
بهمن بهرام نژاد
استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :