پیش بینی و مقایسه بیوانفورماتیکی محل فعالیت پروتئین های فسفات ترانسپورتر در گیاهان و جانوران

هان و جانوران تعداد 100 توالی اسید آمینه ای مربوط به این پروتئین ها از پایگاه NCBI گرفته شد و توسط نرم افزا رهای سایت CBS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. بررسی ها نشان داد که بیشترین فعالیت این پروتئی نها در گیاهان، در سیتوزول و هسته با 73 % و کمترین فعالیت در کلروپلاست با 7% است. همچنین در جانوران بیشترین فعالیت در مسی رهای ترشحی که به شبکه آندوپلاسمی ختم می شود با 73 % و کمترین فعالیت در میتوکندری با 10 % است. مقایسه اندازه طول توال یها در گیاهان و جانوران نشان داد که طول توالی های موجود در جانوران بزرگتر است که به نظر می رسد به دلیل تعداد بیشتر توالی های پپتید نشانه در انتهای آمینی آ نها است که سبب هدایت این پروتئی نها به سمت محل هدف می شود. همچنین بررس یها نشان داد که برنام هی رایانه ای، محل فعالیت پروتئین های فسفات ترانسپورتر در جانوران را با ضریب اطمینان بیشتری پیش بینی کرده است به طوری که در جانوران 60 % توالی ها با ضریب احتمال بیش از 80 % پیش بینی شده است ولی در گیاهان تنها 5% توالی ها با ضریب احتمال بیش از %80 پیش بینی شده است.

کلیدواژه ها:

فسفات ترانسپورتر ، پپتید نشانه ، میتوکندری ، شبکه آندوپلاسمی