بررسی ترجیح کذونی ژن های رمز کننذه فسفات ترانسپورتر در گیاهان مختلف

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 491

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_052

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی ژن هایا رمز کننده فسفات ترانسپورتر در گیاهان مختلف توالی 50 آیزوفرم از 7 گیاه مختلف از پایگاه NCBI تهیه شد و توسط برنامه Gene Infinity مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت و با استفاده از تجزیه کلاستر میزان تشایه ترجیح کدنی ژن های رمز کننده فسفات ترانسپورتر مشخص شد. نتایج نشان داد که برای اکثر اسید آمینه ها کدونی ترجیح داده شده بود که نوکلئوتید انتهایی ان G یا C بود و برعکس برای همان اسید امینه ها کمترین ترجیح برای کدونی هایی بود که دارای A یا T T نوکلئوتید آخر خود بودند. در اسیدهای امینه دارای 4 کدون همانند الانین Ala گلایسین Gly پرولین Pro و تیروزین Thr بیشترین ترجیح برای کدونی بود که دارای نوکلئوتید انتهایی C یا G بود. از میان گیاهان مورد بررسی تنها سویا ان هم برای کدن ها اسید امینه ایزولوسیون و چایان بیشتر از کدون هایی استفاده کرده بود که در انتهای خود نوکلئوتید A یا T داشتند. بر اساس نتایج تجزیه کلاستر در مورد کدون های اسید آمینه های 4 و 6 کدنی گیاهان خانواده گندمیان در یک گروه مجزا از سایر گیاهان قرار گرفتند. در نهایت می توان پیشنهاد داد که در اکثر گیاهان مورد بررسی ترجیح کدونی یکسانی برای ژن های رمز کننده فسفات ترانسپورتر وجود دارد و میزان این شباهت در بین گیاهان یک خانواده بیشتر از گیاهان منعلق به خانواده های مختلف است.

نویسندگان

محمد فاضل سلطانی

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

محسن جم

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

عباس عالم زاده

استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Eastmond, P.J. and Graham, I.A. 2003. Trehalose metabolism: a regulatory ...
  • Ermolaeva, M.D. Synonymous codon usage in bacteria. 2001. Current Issues ...
  • Froelich, P.N., Bender, M.L., Luedtke, N.A., Heath, G.R. and DeVries, ...
  • Ohama, T., Muto, A. and Osawa, S. 1990. Role of ...
  • Slomp, C.P. and Van Cappellen, P. 2007. The global marine ...
  • Wain-Hobson, S., Nussinov, R., Brown, R.J. and Sussman, J.L. 1981. ...
  • نمایش کامل مراجع