بهینه سازی کدونی ژن کد کننده سیتوکروم باکتریایی 450P برای انتقال به خانواده سولاناسه جهت کاهش اثرات علف کش ها
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 664
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_066
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
چکیده مقاله:
تکنولوژی DNA نوترکیب امکان انتقال ژن از یک گونه به گونه هایی کاملا متفاوت را فراهم آورده است اما مسئله حائز اهمیت بیان مناسب این ژ نها در گونه گیرنده است. موجودات مختلف برای بیان ژ نها، کدون های خاصی را ترجیح م یدهند. کارایی فرآیند ترجمه از فراوانی کدو نهای بکار رفته در ژن تاثیر می پذیرد بنابراین برای رفع مشکلات کلون کردن ژ نها و انتقال آن ها از یک گونه به گونه ای غیرخویشاوند بهین هسازی کدونی امری ضروری است. برای تسریع و سهولت مبارزه شیمیایی با علف های هرز خانواده سولاناسه که از نظر ارزش غذایی و اقتصادی بسیار مورد توجه است ایجاد ارقام مقاوم به عل فکش راهکاری کاربردی است. آنزیم سیتوکروم 450 P سمیت عل فکش را در گیاه کاهش می دهد و گیاهان دارای این آنزیم م یتوانند سطح بالاتری از عل فکش را تحمل نمایند، بدین منظور توالی ژن کد کننده سیتوکروم 450 P از باکتری Sfreptomyces griseolus با شماره دست یابی 426708 AB از سایت (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)NCBI دریافت شد و با نرم افزار Vector NTI advance11 بهینه و سایر آنالیزها با نرم افزار DNAStar انجام شد. نتایج بدست آمده نشان داد درصد GC در توالی اولیه از 68 % به 39 % در توالی بهینه شده کاهش یافته است، که به دلیل تغییر در نوع کدونهای ترجیحی می باشد. مقایسه توالی منشا و توالی بهینه شده، تغییر در کدونهای ترجیحی، جایگاه شناسایی آنزیم های برشی و ترکیب بازها را نشان داد و در نهایت ترجمه هر دو توالی، مشخص شد هر دو توالی آمینو اسیدهای کاملا یکسانی را کد می کنند و بهینه سازی هیچ تغییری در نوع و ترتیب آمینو اسیدها به وجود نیاورده است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
بهناز دولت آبادی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبی
غلامعلی رنجبر
دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی
مسعود توحیدفر
دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
علی دهستانی کلاگر
استادیار پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :