شبیه سازی جمعیت اولیه (تاریخی) و تعیین صحت عدم تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه سازی ژنومی

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 737

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_072

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

جهت بررسی صحت عدم تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه سازی ژنومی ، جمعیتی در دو حالت عدم تعادل پیوستگی صفر و یک در نسل اول شبیه سازی شد. از معیارهای اندازه موثر جمعیت میزان عدم تعادل پیوستگی و واریانس بین نشانگرها جهت تعیین صحت شبیه ساری استفاده شد. نتایج نشان دهنده همبستگی زیاد بین اندازه موثر جمعیت مشاهده شده و مورد انتظار بود. همچنین میزان عدم تعادل پیوستگی مشاهده شده و مورد انتظار بر هم منطبق شدند و چنین روندی با افزایش اندازه جمعیت موثر وضعیت مطلوب تری پیدا کرد. به علاوه میزان واریانس مشاهده شده و مورد انتظار بین نشانگرها در حالت نو ترکیبی آزاد نیز بر یکدیگر منطبق شدند. با توجه به معیارهای مورد بررسی می توان گفت که جمعیت اولیه به درستی شبیه ساری شده استو می توان از ان برای توسعه جمعیت مرجع استفاده کرد. با توجه به نتایج به دست امده پیشنهاد می شود در مطالعات شبیه سازی ژنومی پس از تشکیل جمعیت اولیه از معیارهای ارائه داده شده جهت بررسی صحت شبیه سازی استفاده شود.

نویسندگان

حسین مهربان

دانشجوی دکتری-ردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

اردشیر نجاتی جوارمی

دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

رضا میرائی آشتیانی

استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

حسن مهربانی یگانه

استادیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amini, S. 2009. Genetic evaluation using genomic selection in granddaughter ...
  • Calus, M. P. L., T. H. E. Meuwissen, A. P. ...
  • Clark, S. A., J. M. Hickey and J. H. Van ...
  • Daetwyler, H. D., R. Pong-Wong, B. Villanueva and J. A. ...
  • de Roos, A. P. W. B. J. Hayes, R. J. ...
  • Falconer, D. S., and T. F. C. Mackay. 1996. Introduction ...
  • Goddard, M. E., and B. J. Hayes. 2007. Genomic selection. ...
  • Haldane, J. B. S. 1919. The combination of linkage values, ...
  • Hayes., B. J. 2007. QTL mapping _ MAS and Genomic ...
  • Hill, W. G. 1981. Estimation of effective population size from ...
  • Hill, W. G, A. Robertson. 1968. Linkage disequilibrium in finite ...
  • Khansefid, M. (2010). Genetic evaluation of animals based on sire's ...
  • Meuwissen, T. H. E., B. J. Hayes and M. E. ...
  • Saatchi, M., S. R. Miraei -Ashtiani, A. Nejati Javaremi, M. ...
  • Solberg, T. R., A. K. Sonesson., J. A. Woolliams and ...
  • Sved, J. A. 1971. Linkage disequilibrium and homozygosity of chromosome ...
  • Toro, M. A., L Varona. 2010. A note on mate ...
  • Villumsen, T. M., L. Janss and M. S. Lund. 2009. ...
  • Weigel, K. _ 201 1. Haplotypes Affecting Fertility and their ...
  • Wellmann, R., J. Bennewitz. 2012. Bayesian models with dominance effects ...
  • Zhang Z, J. Liu, X. Ding, P. Bijma, D. J. ...
  • نمایش کامل مراجع