تجزیه و تحلیلی بیوانفورماتیکی کدون بیاس

درموجودات مختلف کدونهای مترادف با فراوانی متفاوتی استفاده میشوند اما یک کدون نسبت به سایر کدونها در اولویت قرار دارد که کدون بیاس خوانده میشود. طبق فرضیه ژنومی کدون بیاس، موجودات مختلف کدون بیاسهای متمایزی دارند. تفاوت در سطوح مقدار GC از پارامترهایی است که تفاوت کدون بیاس را بین موجودات تعیین میکند. مطالعات بسیاری با استفاده از اطلاعات موجود درپایگاههای اینترنتی در زمینه کدونهای مورد استفاده و کدون بیاسها جهت درک بهتر روند تکاملی گونههای مختلف، صورت گرفته است. علاوه بر این توسط این پایگاهها میتوان اطلاعاتی راجع به شاخص سازگاری کدون که نشان دهنده بیشترین فراوانی کدونهای فعال در ژنهای با بیان بالا است، میانگین درصد GC و نسبتهای کدونهای مترادف، به دست آورد. نرم افزارهای بیوانفورماتیکی مرتبط برای تغییر و بهینه کردن کدونهای فعال درون توالیهای نوکلئوتیدی، پیش بینی قدرت ترجمه توالی و در نهایت پیش بینی میزان تولید پروتئین، مورد استفاده قرار میگیرند. در واقع از طریق این نرم افزارها میتوان ژنهایی با سطح بیان بالاتر در یک سلول ویژه و همچنین توالیهای ژنی کارآمدتر به منظور انتقال به یک ارگانیسم دیگر، طراحی کرد. از این تغییر در توالی میتوان در تولید انبوه داروهای نوترکیب و سایر زمینههای بیوتکنولوژیکی بهره گرفت. در این مقاله به بررسی کاربرد بالفوه کدون بیاس در برنامه های به نژادی و ژنتیکی می پردازیم.