تعیین روابط فیلوژنی برخی ارقام مرکبات ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولیITS

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 488

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF و WORD قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGROCONGRESS01_116

تاریخ نمایه سازی: 16 خرداد 1394

چکیده مقاله:

اطلاع از روابط فیلوژنتیک و تنوع ژنتیک در مرکبات جهت تشخیص روابط ژنتیکی، شناسایی ژرم پلاسم و ثبت ارقام جدید، امری مهم و ضروری می باشد. در کلکسیون های مرکبات کشور، تعدادی بیوتیپ وجود دارد که شناسایی آنها عمدتاً بر اساس صفات مرفولوژی بوده و تحقیقات ژنتیکی چندانی بر روی آنها انجام نشده است. با توجه به اینکه نشانگرهای ملکولی می توانند در تعیین روابط ژنتیکی مفید باشند، در این پژوهش جهت بررسی میزان تنوع و قرابت ژنتیکی 45 ژنوتیپ مرکبات شامل 33 ژنوتیپ ناشناخته بومی همراه با 12 رقم تجاری، از نشانگر ITS استفاده شد. ناحیه ITS هسته در ارقام مرکبات با استفاده از یک جفت پرایمر تکثیر شد. محصول PCR نمونه ها برای تعیین توالی به شرکت ژن فناوران فرستاده شدند. جهت مقایسه توالی های به دست آمده با توالی گونه های دیگر این جنس و نیز جنس های دیگر از توالی های موجود در Genbank استفاده گردید. داده ها با استفاده از روش ماکزیمم پارسیمونی به کمک نرم افزار PAUP4.0 و همچنین روش Bayesian به کمک نرم افزار MrBayes3.2 آنالیز شدند. موقعیت تمام ارقام مرکبات در خوشه های موجود در کلادوگرام حاصل از داده های ITS تا حدودی با ویژگی های مرفولوژی تاکسای اصلی مطابقت دارد. این پژوهش همچنین از بالنگ، پوملو و نارنگی به عنوان سه گونه اصلی مرکبات حمایت می کند به طوری که این گونه ها به عنوان منشأ سایر ارقام محسوب می شوند. تجزیه تنوع ژنتیک و تعیین روابط خویشاوندی در مرکبات، اطلاعات مفیدی را برای برنامه های به نژادی، انتخاب و حفظ ارقام فراهم می کند.

نویسندگان

هاجر بخشی پورمیانده

باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی تهران، ایران

ایرج مهرگان

استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران

بهروز گلعین

استادیار، موسسه تحقیقات مرکبات کشور، رامسر، ایران

سارا سعادتمند

استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amar, M.H., Hassan, A.H.M., Kumar B.M., Dulloo, E., Xie, Z.Z. ...
  • Barret, H. C. and A. M. Rhodes. 1976. A numerical ...
  • Felsenstein, J. 1985. Confidence limits on phylogenies: An approach using ...
  • Gmitter, F. G., J. W. Grosser and A. G. Moore. ...
  • Golein B, Nazeryan M and Babakhani B, 2011. Assessing genetic ...
  • Golein, B. and B. Adou. 2011. Citrus 1. Novin Poya ...
  • Graham, J., R. J. Mc Nicole and J. W. Mc ...
  • Herrero, R., M. J. Asins, E. A. Carbonell and I. ...
  • Hynniewta, M., Kumar M. S. and Rama . S. 2014. ...
  • Kollipara, K.P., Singh, R.J. and Hymowitz, T. 1997. Phylogenetic and ...
  • Kumar, S., Nair, K.N. and Jena, S.N. 2013. Molecular differentiation ...
  • Kyndt, T., Dung, T.N., Goetghebeur, P., Toan, H.T. and Gheysen, ...
  • Li, X. and Xie, R. 2010. The Origin of Cultivated ...
  • Morton, C.M., Grant, M. and Blackmore, S. 2008. Phylogenetic relationships ...
  • Murry, M. G. and W. F. Thompson. 1980. Rapid isolation ...
  • Posada, D. and Crandall, K. A. 2000. MODELTESI testing the ...
  • Ronquist, F., Huelsenbeck, J.P. 2003. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference ...
  • Shahsavar, A. R., K. Izadpanah, E. Tafazoli andl B. E. ...
  • Soltis, D. E. and Soltis, P. S. 2003. The role ...
  • Swingle, W.T. and P.C. Reece. 1967. The botany of Citrus ...
  • White, T.J., Bruns, T.D., Lee, S.B. and Taylor, J.W. 1990. ...
  • نمایش کامل مراجع