تجزیه وتحلیل عملکردیQTLهای مرتبط با مقاومت غیر میزبانی در جو نسبت به قارچ های عامل زنگ برگی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 552

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF و WORD قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGROCONGRESS01_577

تاریخ نمایه سازی: 16 خرداد 1394

چکیده مقاله:

بیماری های گیاهی رشد و توسعه گیاه را تحت تأثیر قرار داده و باعث کاهش محصول وکیفیت آن می شوند. گیاهان برای مقابله با عوامل بیماریزا سیستم های مقاومت را گسترش داده اند. در پژوهش حاضر به منظور تجزیه وتحلیل فعالیت ژن های مقاومت ، عملکرد QTLهای مرتبط با مقاومت غیر میزبانی جو نسبت به زنگ برگی در جمعیت Susptrit* Cebadacaba ، مورد بررسی قرار گرفت. این QTLها که حاصل مطالعات قبلی بود از منابع استخراج و هم وقوعی نشانگرهای مرتبط با هر یک از آن ها با نشانگرهای SNP دارای توالی مشخص بررسی گردید. نشانگرهای SNP دارای هم وقوعی بالا انتخاب شد و با استفاده از الگوریتم BLASTX، توالی هر یک از ژن های مرتبط مشخص و با توالیهای پروتئینی ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی آرابیدوپسیس مقایسه گردید . شماره دسترسی پروتئین دارای کمترین E-value ، برای تعیین گروه های کارکردی ، در آدرس http://www.arabidopsis.org/tools/bulk/go/index.jsp وارد شد. نتایج حاصل نشان داد که در حوزه عملکرد مولکولی، ژن ها های کاندید مرتبط با مقاومت فعالیت ترانسفرازی بیشتری دارند. فعالیت هیدرولازی وکینازی ژن های کاندید نیز قابل توجه بود. نقش پروتئین کینازها برای مقاومت در برابر پاتوژن ها ضروری است. ژن ها در فرایندهای سلولی، متابولیکی، رونویسی، پاسخ به تنش و هدایت سیگنال، به ترتیب بیشترین فعالیت را داشتند. محصولات ژنی به ترتیب در هسته، کلروپلاست وغشای پلاسمایی بیشتر فعال بودند که نشان دهنده ارتباط زیاد این اندامک ها با پاسخ دفاعی گیاه است.

نویسندگان

انسیه میرزاعلی بابایی

دانشجوی کارشناسی ارشد رشته اصلاح نباتات دانشگاه زنجان

حسین جعفری

مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی زنجان

محمدرضا عظیمی مقدم

گروه اصلاح نباتات دانشگاه زنجان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • - اگریوس، ج.ن. 1376. بیماریهای قارچی گیاهان. ترجمه مهرآوران، ح. ...
  • Alves, M. S., Silvana, Amanda P. D., Goncalves, B., de ...
  • Atkinson, N. J., Lilley, C. J. and Urwin, P. E. ...
  • Belhaj, K., Lin, B _ _ Mauch, F. 2009. The ...
  • Blumwald, E., Aharon, G. S., Lam, B. C. 1998. Early ...
  • C olcombet, J., Hirt. H. 2008. Arabidopsis MAPKs: a complex ...
  • C owan-Jacob , S. W. 2006. Structural biology of protein ...
  • Dixon, D.P., Lapthorn, A. and Edwards, R. 2002. Plant glutathione ...
  • Diehl, A.D., Lee , J.A., Scheuermann, R.H., Blake, J.A. 2007. ...
  • Eillbeck, K. and Lewis, S.E. 2004. Sequence Ontology annotation guide. ...
  • Fernandez, _ . Davies, T.G, Coleman O.D. and Rea, P.A. ...
  • Henrissat, B., Callebaut, I., Mornon, J.P., Fabrega, S., Lehn, P., ...
  • Jafary, H., Albertazzi _ G., Marcel, T.C. and Niks, R. ...
  • Mathre, D. E. 1985. Compedium of Barley Disease. American P ...
  • Marcel, T. C. , Varshney, R. K. , Barbieri, M. ...
  • Moreno, JI., Martin, R. and Castresana, c. 2005. Arabidopsis ...
  • Niks, R., Lindhout , P., Bai , Y. &Parleviet , ...
  • Nomura, H.i , Komori, T., Uemura, S. , Kanda , ...
  • _ -Nowakowsk , J., Cronin , C.N. McRee, D.E., Knuth, ...
  • Palmgren, M.G. 2001. Plant Plasma Membrace H*-ATPase: Powerhouses for Nutrient ...
  • Poland, J.A., P.J. Balint-Kurti, R.J. Wisser, R.C. Pratt, and R.J. ...
  • Qi, X., Niks, Stam, R. E.P., Lindhout, P.1998. Identification of ...
  • _ -Riechmann, J.L. 2006. Transcription Factors of Arabidopsis and Rice: ...
  • Romeis, T.2001, Protein kinases in the plant defence response, Elsevier ...
  • Rudd, S. 2003. Expressed sequence tags: alternative or complement to ...
  • Sarowar, S., Kim, Y.J. Kim, K.D. wang, H. , B.K ...
  • Singh, K.B., Foley, R.C. and sanchez, L. O. 2002. Transcription ...
  • Shah, J. 2005. Lipids, Lipases, and Lip id-Modifying Enzymes in ...
  • Sharma, V., Sekhwal, M. K., Sarin R.2013 Annotation of glycoside ...
  • Stansfield K..R.C, , w.D. and Mulligan, p.k. 2006. A Ditionnary ...
  • Young, N.D _ 1996. QTL mapping and quantitative disease resistance ...
  • Van Verk, M.C., Gatz, C., Linthorst, H.J.M. 2009. Transcriptional regulation ...
  • Wang, H., 2011. Identification and Dissection of Soybean QTL Conferring ...
  • Woloshen, Huang, V. S., Li, X. 2011. RNA-Binding Proteins in ...
  • Xing, T., Higgins, V.J. and Blumwald, E. 1997. Race-specific elicitors ...
  • نمایش کامل مراجع