بررسی برخی از ارقام برنج به بیماری بلاست با استفاده از نشانگرهای اختصاصی ریزماهواره پیوسته با ژن های مقاومت

در این پژوهش به منظور بررسی ارقام برنج نسبت به بلاست، 32 رقم از ارقام بومی برنج چند لاین شناخته شده و چند لاین خارجی انتخاب و در گلخانه دانشکده کشت شد سپس نمونه برگی به منظور استخراج DNA ژنومی تهیه شد که از 4 نشانگر ریزماهواره مرتبط با صفات و QTL های مربوط به بلاست استفاده شد، که همه آن ها چند شکلی بین ژنوتیپ ها را نشان دادند. در مجموع نشانگر ها در بین 32 ژنوتیپ، 12 باند تشکیل دادند که همه ی آن ها (100 در صد) چند شکل بودند. بالا ترین میزان PIC برای نشانگر های RM155 (PIC=0.55) تعیین شد که بیانگر کارایی بالا تر این نشانگر در تمایز ژنوتیپ های مورد استفاده در این تحقیق می باشد. سپس تجزیه خوشه ای با روش متوسط فاصله بین کلاستر ها (UPGMA) و محاسبه سه ضریب تشابه تطابق ساده، جاکارد و دایس انجام شد. نتایج محاسبه ضریب همبستگی کوفنتیک نشان داد که گروه بندی بر اساس ضریب جاکارد، بهترین روش گروه بندی از بین روش های مورد بررسی است. میزان این ضریب در این روش 0.92 بود. این رقم بیان گر کارایی بالای این روش در گروه بندی ژنوتیپ ها است.

کلیدواژه ها:

برنج ، بلاست ، نشانگرهای ریزماهواره