شناسایی تنوع ژنتیکی 144 ژنوتیپ جو با استفاده از نشانگرهای SSR و EST-SSR و مقایسه کارایی این نشانگرها

برآورد سطح تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیت یک گام ضروری برای حفظ منابع ژنتیکی و توسعه استراتژی های آتی برای برنامه های به نژادی می باشد. در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی 144 ژنوتیپ جو شامل 25 لاین اصلاحی و تجاری و 119 توده بومی جمع آوری شده از کشورهای مختلف، با استفاده از 25 نشانگر SSR و 21 نشانگر EST-SSR مطالعه شد. 22 نشانگر EST-SSR برای برآورد تنوع ژنتیکی 144 ژنوتیپ استفاده گردید که از بین آنها 21 نشانگر الگوی چند شکلی نشان دادند. میانگین تنوع ژنی، میزان اطلاعات چند شکلی PIC و فراوانی الل شایع به ترتیب برابر 0/58، 0/52، 0/53 بدست آمد. طبق آنالیز AMOVA 88% واریانس مولکولی کل به درون گروه ها و 12% آن در بین گروه ها تبیین گردید. در مجموع 134 الل برای 28 نشانگر SSR مورد استفاده شناسایی گردید، متوسط تنوع ژنی، PIC و فراوانی الل شایع به ترتیب 0/63، 0/58، 0/48 بدست آمد. بر طبق تجزیه واریانس مولکولی 91 % واریانس کل به درون گروه ها و 9% آن به بین گروه ها منصوب گردید.

کلیدواژه ها:

جو ، تنوع ژنتیکی ، نشانگرهای مولکولی ، EST-SSR ، SSR