بررسی قرابت ژنتیکی ژنوتیپ های مختلف انار (.Punica granatum L) در جنوب استان کرمان براساس تجزیه توالی نوکلئوتیدی ناحیه بین ژنی PsBe- PetL

انار (.punica granatum) از میوه های شناخته شده بومی ایران است. در حال حاضر ایران یکی از تولید کنندگان مهم و دارای غنی ترین ذخایر ژنتیکی انار است. اگرچه مارکرهای مبتنی بر خصوصیات مورفولوژیکی بطور گسترده ای در شناسایی ارقام انارمورد استفاده قرار می گیرند، اما بدلیل اینکه بشدت متاثر از شرایط محیطی هستند کارایی زیادی ندارند. در سالهای اخیر از مارکرهایمولکولی متعددی مانند SSR ،AFLP ،RAPD برای ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های انار استفاده شده است. نتایج تحقیقات صورت گرفته بر اساس این نشانگرها در انار حاکی از چندشکلی پایین بین ژنوتیپ های آن علیرغم تنوع مورفولوژیک بوده است. در اینپژوهش از توالی یابی ناحیه بین ژنی psbE-petL ژنوم کلروپلاستی جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین ژنوتیپ های انار جنوب استان کرمان با توالی های موجود در بانک ژن استفاده شد. استخراج DNA ژنومی از برگ های انار جمع آوری شده براساس روش هانگ و همکاران (2000)، انجام و تکثیر قطعه دی ان ای مورد نظر توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز با جفت آغازگر اختصاصی F21 psbE-petL psbE-petL/R21 انجام گرفت. در تمامی نمونه های مورد بررسی، قطعه ای از دی ان ای به اندازه تقریبی 700 جفت باز تکثیر شد. قطعات دی ان ای تکثیر شده پس از تخلیص، تعیین توالی شده و تعلق آنها به ژنوم کلروپلاستی انار با استفاده از نرمافزار BLAST و جستجو در NCBI بررسی و تعیین شد. ویرایش توالی های بدست آمده با استفاده از نرم افزار BioEdit و ترسیمدرخت فیلوژنتیکی با کمک نرم افزار MEGA5 انجام گرفت. نتایج نشان داد که ناحیه بین ژنی psbE-petL به خوبی قادر به تمایز ارقام مختلف انار و تعیین قرابت آنها با یکدیگر می باشد و می توان از آن به عنوان نشانگر مناسب برای بررسی تنوع بین ارقام اناراستفاده کرد.

کلیدواژه ها:

انار ، تنوع ژنتیکی ، ژنوم کلروپلاستی ، ناحیه بین ژنی psbE ، petL