بررسی موقعیت تاکسونومیک چند گونه از قارچ Fusarium بر پایه آنالیز ژن EF-1α

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 935

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_102

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

فاکتورهای بسط دهنده ترجمه، پروتئین هایی هستند که در فرایند ادامه ترجمه mRNA به صورت مجموعه ای در داخل زیر واحدهای ریبوزوم نقش داشته و انرژی لازم برای فعالیت خود را از نوکلوئیک اسید GTP دریافت میکند. بحث در مورد شباهت و تفاوتهای احتمالی ژنهای کدکننده این پروتئین میتواند جزئیات بیشتری را از پیچیدگی این گروه مشخص کند . در این بررسی ژنهای کدکننده پروتئین translation elongation factor-1 alfa متعلق به گونه های مختلف جنس Fusarium از بانک ژن NCBI استخراج و داده های فیلوژنتیکی پس از تطبیق دهی توالی ها،توسط نرم افزار MEGA 6 به دو روش حداکثر احتمال و اتصال همسایگی خوشه بندی شدند. توالی های مورد مقایسه در این گروه تشابهات و تفاوتهای قاب ملاحظه ای را نشادن داد. دندروگرامهای حاص ، گونه های مورد بررسی را در دو خوشه اصلی قرار داد و دو گونه از قارچ Trichoderma و Armillaria در هر دو روش در گروهی خارجی با دورترین خویشاوندی به دو گروه اصلی قرار گرفتند. با توجه به نقش اساسی پروتئینهای حاص از ترجمه این ژن در فرایند سنتز سایر پروتئین های قارچی، این توالیها میتوانند کاندیدی برای مطالعات فیلوژنتیکی نیز باشند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

امیرمسعود حیدری نژاد

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

اصغر آذری سقرلو

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Darvishnia, M., A. Alizade, R. Zare, E. Mohammadi. 2006. Three ...
  • Desjardins, A.E. 2006. Fusarium mycotoxins: chemistry, genetics, and biology. American ...
  • Hall, T. 2004. BioEdit version 7.0. 0. Distributed by the ...
  • Leslie, JF and BA. Summerell. 2006. The Fusarium laboratory manual, ...
  • Negrutskii, BS and AV. El'skaya.1998. Eukaryotic translation elongation factor 1 ...
  • Saeys, Y., I. Inza and P. Larraiaga. 2007. A review ...
  • Saitou, N. and M. Nei. 1987. The ne ighbor-joining method: ...
  • Sasikumar, AN., W.B. Perez and T.G. Kinzy. 2012. The many ...
  • Tamura, K., G. Stecher, D. Peterson, A. Filipski and S. ...
  • Yang, Z. 1997. PAML: a program package for phylogenetic analysis ...
  • نمایش کامل مراجع