نسل جدید تعیین توالی و کاربرد آن در فیلوژنی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,016

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_302

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

نسل جدید تعیین توالی به عنوان انقلابی در مطالعات زیستی توانسته است با تعیین توالی کل ژنوم به طور زیادی زمان و هزینه ی تعیین توالی را کاهش دهد. به طوری که نویدبخش نسل سودمند و سریع تکثیر توالی های چند جایگاهی برای فیلوژنی و فیلوجغرافیایی هستند، هرچند تکیه بر موجوادت بدون مدل و همچنین سخت و هزینه بر بودن روش های آماده سازی نمونه و توسعه نیافتن همگام نرم افزارها با این تکنیک در جهت آنالیز های مناسب، باعث روند بسیار کند استفاده از نسل جدید تعیین توالی در فیلوژنی شده است. با این حال این تکنیک توانسته است سبب بازسازی دقیق تر روابط فیلوژنی شده و مشکلات مربوط به پلی پلوییدی و هیبریداسیون را تا حدود زیادی مدیریت کند و به عنوان الترابارکدینگ در سطح زیرگونه به کار رود

کلیدواژه ها:

تعیین توالی ، فیلوژنی ، تعیین توالی نسل بعد یا جدید ، تکنیک

نویسندگان

اکرم کاوه

دانشجوی دکتری، دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی

هانیه نفیسی

دانشجوی دکتری، دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی

شاهرخ کاظم پور اوصالو

دانشیار، دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • سطوح زیر گو نه کا ربر د د ا ر ...
  • همکا ر ا نش می تو ا ند د لیل ...
  • Amirahmadi A Kazempour Osaloo S, Moein F, Kaveh A, Maassoumi ...
  • Ansorage, W.J. (2009). Next generation DNA sequencing techniques. Nat Biotechnol ...
  • Carsten B, Lemmon A.R and Lemmon E. M. (2012). The ...
  • Cronn R, Knaus B, J., Liston A, Maughan P, J., ...
  • Davey J.W., Hoenlohe P.A., Etter P.D., Boone J.Q., Catchen J.M., ...
  • Deschamps S. and Campbell M. A.. (2010). Utilization of next-gen ...
  • Egan A. N., Schlueter J., and Spooner D. M. (2012). ...
  • Griffin P. C., Robin C., and Hoffmann A. A. (2011). ...
  • Harrison N., and Kidner Catherine (2011) Next- generation sequencing and ...
  • Ilut, D.C., Coate, J.E, Luciano, A.K. Owens, T.G., May, G.D., ...
  • Judson A. Ward, Lalit Ponnala, and Courtney A. Weber. (201 ...
  • Kane N, Sveinsson S, Dempewolf H, Yong Y, J, Zhang ...
  • Kaveh, A. and Kazempour Osaloo, Sh. (2010) The genus Ebenus ...
  • Lexer C, Mangili S, Bossolini E, Forest F, Stolting KN, ...
  • Li, X., Wu, H.X. & Southerton, S.G. (2010). Comparative genomics ...
  • Liu, L., Liu L., Li Y., Li S., Hu N., ...
  • Mamanova L. Coffey A. J., Scott C. E., Kozarewa I., ...
  • Maso udi-Nejad (2013). Next Generation Sequencing and Sequence Assembly. SpringerBriefs ...
  • Martin, W., O. Deusch, N. Stawski, N. Grunheit, and V. ...
  • McCormack JE, SM Hird, AJ Zellmer, BC Carstens & RT ...
  • Metzker M. L.(2010). Sequencing techno logies--The next generation. Nature Reviews ...
  • Moore, M.M. Bell, C.D., Soltis, P.S. & Soltis, D.E. (2007). ...
  • Parks, M., Cronn, R. & Liston, A. (2009). Increasing phylogenetic ...
  • Shendure, J. & Ji, H. (2008). Nex-gen eration DNA Sequencing. ...
  • Shi C, Hu N, Huang H, Gao J, Zhao Y-J, ...
  • Stapley J, Reger J, Feulner PGD, Smadja C, Galindo J, ...
  • Straub Shannon C. K., Matthew Parks, Kevin Weitemier, Mark Fishbein, ...
  • Strickler S. R., Bombarely A., and Mueller L. A. (2012). ...
  • Suzuki S., Ono N., Furusawa C, Ying B-W., Yomo T ...
  • Timme, R.E. & Delwiche, C.F.(2010). Uncovering the evolutionary origin of ...
  • Uribe-Convers, S., Duke J.R., Moore M.J., and Tank D., 2014. ...
  • Zhang X., Liu G., Yin Y., Chen K. (2010). The ...
  • نمایش کامل مراجع