سنجش بیان واریانت جدید از یک رونوشت مشترک بین دو ژن مجاور TCF19 و OCT4

؛ EST ها خوانش هایی از توالی های عموما در اندازه ی 500 جفت باز هستند که معمولا نماینده ی بخشی از رونوشت ژن می باشند . بنابراین می توان با مطالعه ی آنها رونوشت جدید یک ژن را کشف کرد . در این مطالعه بیان سه EST گزارش شده در سال 2010 مورد سنجش قرار گرفته است که توالی آنها بین دو ژن مجاور 19 TCF و OCT4 هم پوشانی دارد . ژن 19 TCF کد کننده ی پروتئینی است که احتمالا به عنوان فاکتور رونویسی عمل می کند و در مسیرهای پیام رسانی از جمله مسیرهای TGF-Beta وPAK شرکت دارد . ژن OCT4 کدکننده ی نوعی فاکتور رونویسی است که نقش مهمی در پرتوانی سلول بنیادی و نمو جنینی دارد . لازم به ذکر است که هر دو ژن فوق دارای پردازش متناوب رونوشت و بنابراین واریانت های مختلف می باشند . جهت بررسی بیان EST های مشترک، پرایمرها براساس توالی آنها طراحی شدند . سپس مراحل سنتز cDNA ، PCR و Real-Time PCR بر روی RNA های استخراج شده از 9 رده ی سلولی انسانی و سلول های بنیادی و تمایز یافته به سلول های شبه قلبی و سلول های شبه عصبی انجام گرفت . همچنین برای تعیین صحت مطالعات، قطعه ی تکثیر شده توالی یابی شد . نتایج : نتیجه ی توالی یابی قطعه ی تکثیر شده ی حاصل از PCR با توالی EST مورد نظرتطابق داشت . از طرفی عدم بیان EST درسلول های تمایز یافته ی شبه عصبی طی آزمایش q-RT PCR مشاهده شد . با مقایسه ی این EST در سطح RNA با توالی DNA مربوط به آن، می توان این احتمال را داد که EST مورد نظر واریانت جدیدی از ژن TCF19 است و از آنجا که با توالی ژن OCT 4 نیز هم پوشانی دارد، امکان ارتباط بین بیان این واریانت و بیان ژن OCT 4 وجود دارد . لذا برای تایید صحت این احتمالات نیاز به مطالعات بیشتر می باشد، چنان که آزمایش Real-Time PCR بر روی رده های سلولی مختلف و بررسی هم زمان بیان ژن OCT 4 و EST مورد نظر در این مطالعه در حال بررسی است.

کلیدواژه ها:

، EST ، ژن OCT 4 ، ژن TCF19 ، واریانت رونوشت