بررسی نقش پرولین ۲۲۰ در آنزیم رنیلا لوسیفراز با استفاده از ابزار داکینگ مولکولی

آنزیم رنیلا لوسیفراز به علت توانایی نشر نور کاربردهای وسیعی دارد. ایجاد جهش های مختلف در پرولین 220 که در دهانه ی فعال آنزیمی قرار دارد، تغییر فعالیت آنزیمی را نشان میدهد. در این مطالعه با استفاده از داکینگ مولکولی توسط نرم افزار molergo نقش این باقیمانده اسید آمینهای در جهش آن به گلوتامیک اسید، ترئونین، گلیسین بررسی شد و خروجیهای حاصل از داکینگ با نرم افزار SPDBV و نیز پایگاه اطلاعاتی Whatif مطالعه شد. با توجه به نتایج داکینگ به نظر میرسد پرولین 220 به طور مستقیم با پیش ماده و محصول میانکنش ندارد و تغییر فعالیت آنزیمی ایجاد شده به علت تغییر در کانفورماسیون دهانه فعال و اثر غیر مستقیم تغییرات ساختاری در میانکنش با پیش ماده و محصول باشد.

کلیدواژه ها:

رنیلا لوسیفراز ، پرولین ۲۲۰ ، داکینگ مولکولی