بررسی تاثیر جهشهای ژن Mtor بر ساختار پروتئین باشبیه سازی دینامیک مولکولی ساختار سه بعدی

مقدمه: mtor پروتئینی موسوم به کیناز هدف راپامایسین در پستانداردن تنظیم کننده اصلی اتوفاژی است و این مسیر را مهار می کند این پروتئین جز خانواده پروتئین کینازهای وابسته به PI3K و PIKKs می باشد. Mtorc1 رشد سلولی را با القای ترجمه، سنتز ریبوزوم و اتوفاژی تنظیم می کند فعالیت این کیناز نیاز به مواد غذایی و آمینواسیدها دارد که منجر به تشکیل mTORC1 به لیزوزومها و اندوزومهای تاخیری بواسطه RAPTOR و باهم قرارگیری فعال کننده های آن RHEB GTP از کوچک می شود . راپامایسین که یک کمپلکس سه گانه با دومن mTOR پروتئین متصل به FK506 و FRB و FJBP12 متصل به راپامایسین را تشکیل می دهد به نظر می رسد که یک مهارکننده آلوستریک باشد شش PIKK پستاندارای فرآیندهای مختلف سلولی را تنظیم می کنند آنها سه ناحیه همولوگ دارند که شامل 600 آمینو اسید در دومن FAT و FRAP ، ATM ، TRAP 300 آمین اسید در دومن کاتنالیتیکی پروتئین کیناز وابسته به PI3K و 35 آمینو اسید در دومن FRAP ، ATM ، TRAP در پایانه کربوکسیلی است در mTOR تقریبا 100 آمینواسید دومن FRB به نظر می ردس که در بین دومنهای FAT و دومنهای کاتالیتیک موجود است و ناحیه پایانه آمینی به دومن FAT برای اتصال به PICTOR,PAPTOR لازم است پروتئین mTOR با 2549 تعداد آمینواسید دارای دومنهای عملکردی است که به ترتیب عبارتند از: دومن پاینه HEAT دومن FAT مرکزی 1513-1910 دومن FRB 2015-5114 و دومنهای سرین ترئونین پروتئین کیناز 2517- 2549 دومن FAT مرکزی 1513-1910 دومن FRB 2015-2114 و دومنهای سرین ترئنین پروتئین کیناز 2517-2549 دومن FRB برای اتصال با راپامایسین مناسب است در مطالعه حاضر با استفاده از روش شبیه سازی دینامیک مولکولی به بررسی تاثیرت جهش در ساختمان پروتئین مذکور پرداختیم.

کلیدواژه ها:

ژنmTOR جهش ، دینامیک مولکولی ، ساختار سه بعدی