پیشگویی مکان تقریبی exon ها درژن ها با استفاده از الگوریتم ترکیبیDFT و تبدیل ویولت و بررسی اثر پنجرههای مختلف در آن

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 821

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CECIT01_377

تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1392

چکیده مقاله:

شناسایی نواحی کدکننده پروتئین در ژنها با استفاده از ابزارهایDSPدر سالهای اخیر به چالشی در بیوانفورماتیک تبدیل شده است. بسیاری از روشهای پردازش سیگنالهای ژنومیک بر مبنای خاصیت تناوب- 3 بازهای موجود در رشتههایDNAمتمرکز ب وده و سپس تحلیلهای طیفی به منظور یافتن موقعیت مولفههای متناوب بر روی توالیهای عددی DNAاعمال میشود. در این مقاله، الگوریتمی بر مبنای ترکیبDFTو تبدیل ویولت به منظور شناسایی نواحی کدکننده پروتئین در توالیDNA ارائه میکنیم. همچنین اثر پنجرههای مختلف در حذف نویز پسزمینه بررسی میشود. نتایج شبیه سازی بر روی چند ژن نشان میدهد که با استفاده از الگوریتم پیشنهادی، می توان موقعیتexonها رادر رشتهDNA بهخوبی آشکار نمود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حمیدرضا صابرکاری

دانشکده مهندسی برق، دانشگاه صنعتی سهند تبریز

موسی شمسی

دانشگاه صنعتی سهند تبریز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • _ D.P. Smustad and M.J. Simmons, "Principles of Genetics", John ...
  • _ _ _ _ Institute, special issue on Genomics, 2004. ...
  • E. N. Trifonov and , L. Sussman, "The pitch of ...
  • X.F. Wan, D. Xu, A. Kleinhofs and J. Zhou, "Quantitative ...
  • J. M. Claverie, "Computational methods for the identification _ genes ...
  • W. F. Doolittle, "Phylogenetic classification and the universal tree", Science, ...
  • P. D. Cristea, "Genomic signals of chromosomes and of concatenated ...
  • _ _ Time Signal Processing", Prentice Hall, Inc, NJ, 1999. ...
  • D. Anastassiou, :Genomic signal processing", IEEE Signal Processing Magazine, vol. ...
  • نمایش کامل مراجع