بررسی تاثیر حذف ژن بر رشد هوازی هالوباکتریوم سالیناروم

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,020

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0625

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

مطالعه تأثیر دستکاری های ژنتیکی با استفاده از مدل متابولیکی یکی از راه های مطالعه عملکرد یک سلول در سطح مولکول برای شناخت بهتر و ارائه راهکارهایی برای بهبود عملکرد آن می باشد. در این تحقیق، تأثیر حذف ژن حذف ژن دوتایی بر رشد هوازی میکروارگانیسم هالوباکتریوم سالیناروم با استفاده از مدل متابولیکی مقیاس ژنوم شامل 478 ژن مورد مطالعه قرار گرفت. برای این منظور، یک محیط کشت شامل 15 اسید آمینه و منبع نیتروژنی آمونیاک برای رشد سلولی در نظر گرفته شد. نتایج حذف ژن نشان می دد که 66 ژن برای رد سلولی ضروری بوده و حذف 44 ژن باعث کاهش میزان رشد می گردد. با استفاده از آنالیز حذف ژن دوتایی، اثرات متقابل ژن ها بر یکدیگر بررسی شد. براساس نتایج محاسبات، 175 ژن از میان ژن های غیرضروری هیچ گونه برهم کنشی با ژن های دیگر ندارند. بیشترین برهم کنش برابر با 222 برهم کنش برای ژن OE2871F بدست آمد. این ژن در تبدیل 3- هیدروکسی بوتانول کوآنزیم آ به استواستیل کوآنزیم آ و احیاء NAD به NADH نقش دارد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

احسان معتمدیان

گروه مهندسی بیوشمی، پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر

ولی الله بابایی پور

گروه مهندسی بیوشمی، پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر

منصور سادات سیدکریمی

گروه مهندسی بیوشمی، پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Oesterhelt, D., (1998). The structure and mechanism of the family ...
  • Barnhart, D. H., W. D. Koek, T. Juchem, N. Hampp, ...
  • Yao, B., M. Lei, L. Ren, N. Menke, Y. Wang, ...
  • Hampp, N., and M. Neebe, (2006). Bacteriorhodop sin-based multi-level optical ...
  • Gonzalez, O., S. Gronau, M. Fallb , F. Pfeiffer, E. ...
  • Gonzalez, O., S. Gronau, F. Pfeiffer, E. Mendoza, R. Zimmer, ...
  • Feist, A. M., J. C. M. Scholten, B. O. Passon, ...
  • Satish Kumar, V., J. G. Ferry, and C. D. Maranas, ...
  • Gonzalez, O., T. Oberwinkler, L. Mansueto, F. Pfeiffer, E. Mendoza, ...
  • Llaneras, F., and J. Pico, (2008). Stoichiometric modelling of cell ...
  • Kauffman, K. J., P. Prakash, and J. S. Edwards, (2003). ...
  • Edwards, J. S., M. Covert, and B. Palsson, (2002). Metabolic ...
  • نمایش کامل مراجع