آنالیز شبکه تنظیمی رونویسی در ژنهای با بیان بالا در بافت چربی

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,286

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0683

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

بافت چربی نقشهای بسیار کلیدی در هموستازی انرژی بدن ایفا کرده و عملکرد آن به عنوان یک غده درون ریز شناخته شده است. شبکه تنظیمی رونویسی درگیر در متابولیسم بافت چربی پیچیده و ناقص می باشد. به منظور درک مکانیسم رونویسی در بافت چربی در انسان، آنالیز EST با استفاده از نرم افزار (DDD) Digital Differential Display انجام گردید. از سایت COXPRESdb به منظور تأئید نتایج حاصل از DDD بوسیله داده های ریز آرایه استفاده گردید. در ادامه برای بررسی شبکه تنظیمی درگیر در متابولیسم بافت چربی، آنالیز شبکه تنظیمی رونویسی با استفاده از نرم افزار PAINT انجام شد. نتایج حاصل از DDD نشان داد که 65 ترنسکریپت در بافت چربی بیان بالاتر از 10 برابر دی بافت چربی نسبت به بافتهای دیگر داردند. نتایج حاصل از COXPRESdb نشان داد که 62% از ژنهای شناسائی شده توسط DDD بیان بالاتر از 1 (در مبنای لگاریتم 2) در آزمایشات میکروارای دارند. مطابق با بررسیهای انجام شده در این مطالعه فاکتورهای رونیوسی (TFs) شامل TFs کاندید که نقش آنها در متابولیسم بافت چربی هنوز شناخته نشده (شامل CKROX, ZF5, ETF, AP-2, AP-2alpha, PAX-5, SPZ1, RBPJ, CACD) شناسائی گردید. نتایج این مطالعه چندین TFs کاندید در متابولیسم بافت چربی را ارائه داد. این نتایج ناشن می دهد که TFs کاندید شناسائی شده احتمالاً دارای نقش تنظیمی در متابولیسم چربی می باشند. با این حال نتایج حاصل از این مطالعه باید توسط مطالعات بیشتر از جمله مطالعات مربوط به آنالیز پروموتور مورد تأئید قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

بافت چربی ، توالی بیان شده برچسب دار ، آنالیز پروموتور

نویسندگان

محمدرضا بختیاری زاده

دانشجوی دکترای ژنتیک و اصلاح دام پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

محمد مرادی شهر بابک

استاد بخش ژنتیک و اصلاح دام پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

اسماعیل ابراهیمی

استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Oishi, Y, Manabe, I., Tobe, K., Tsushima, K., Shindo, T., ...
  • Chen, C. H., Lin, E. C., Cheng, W. T., Sun, ...
  • Kershaw, E. E., Flier, J. S., 2004. Adipose tissue as ...
  • Rosen, E. D., MacDougald, O. A., 2006. Adipocyte differentiation from ...
  • Kim, S. J., Lee, K. H., Lee, Y. S., Mun, ...
  • Lee, K. T., Byun, M. J., Lim, D., Kang, K. ...
  • Li, X, Thomason, P. A., Withers, D. J, Scott, J., ...
  • Lim, D., Lee, S. H., Cho, Y. M., Yoon, D., ...
  • Dozmorov, M. G., Kyker, K. D., Saban, R., Knowlton, N., ...
  • Juskeviciute, E., Vadigepalli, R., Hoek, J. B., 2008. Temporal and ...
  • Vadigepalli, R., C hakravarthula _ P., Zak, DE.., Schwaber, J. ...
  • Eujayl, I., Morris, C., 2009. Identiication of differentially expressed UniGenes ...
  • Obayashi, T., Kinoshita, K., 2011. COXPRESdb a database to commpare ...
  • Scheurle, D., DeYoung, M. P., Binninger, D. M., Page, H., ...
  • نمایش کامل مراجع