توالی یابی ژنوم Oceanimonas sp. GK1 و شناسایی مسیر متابولیسمی و پتانسیل مولکولی تولید پلاستیک زیست تخریب پذیر پلی هیدروکسی بوتیرات (PHB)

در این تحقیق باکتری اکسترموفیل سازگار با شوری Oceanimonas sp. GK1 از تالاب گاوخونی جداسازی شده و پس از شناسایی از طریق آزمایشات ماکروسکوپی و میکروسکوپی میکروبیولوژی و تأئید توانایی تولید با راندمان بالای پلیمر ارزشمند پلی هیدروکسی بوتیرات (PHB) به عنوان پلاستیک تجزیه پذیر زیستی وارد مرحله استخراج DNA ژنومی و توالی یابی ژنوم گردید. توالی یابی ژنوم با استفاده از تکنولوژی 454 GS-FLX Titanium صورت گرفت. نتایج توالی یابی ژنومی به اندازه 3514637 جفت باز به عنوان کروموزوم اصلی و دو پلاسمید به اندازه های 8462 و 4245 جفت باز را نشان داد. نتایج حاصل از توالی یابی به عنوان نخستین ژنوم بومی کاملاً توالی یابی شده ایران در پایگاه اطلاعاتی معتبر NCBI به شماره «CP003171» ثبت گردید. مشخصات ژنها و موقعیت آنها و نیز اطلاعات دقیق مربوط به شرایط متابولیسمی باکتری از روی توالی نکلئوتیدی استخراج شده و در نهایت ژنها و مسیر متابولیسمی تولید پلیمر بتا هیدروکسی بوتیرات در این باکتری شناسایی گردیدند.

کلیدواژه ها:

اکسترموفیل ، توالی یابی ژنوم ، پلی هیدروکسی بوتیرات (PHB)