توالی یابی ژنومNesterenkonia sp. Strain F و شناسایی پتانسیل ژنتیکی آن

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 842

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0751

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

در این تحقیق از دریاچه شور آران و بیدگل نمونه برداری انجام گرفت. بعد از جداسازی و شناسایی میکروارگانیسم های موجود در نمونه های مذکور، باکتری شوردوست Nesterenkonia sp. Strain F جهت بررسی خصوصیات ژنومی و پتانسیل ژنتیکی جنس مذکور انتخاب و بعد از استخراج DNA با استفاده از تکنولوژی 454 GS-FLX Titanium توالی یابی شد. اندازه ژنوم باکتری Nesterenkonia sp. Strain F به طول 2812133 جفت باز تعیین گردید. نتایج حاصل از توالی یابی به عنوان نخستین درفت (Draft) ژنوم بومی ایران و به عنوان ژنوم اولین سویه از جنس Nesterenkonia در پایگاه اطلاعاتی معتبر NCBI به شماره «AFRW00000000» ثبت گردید. مشخصات ژنها و موقعیت آنها و نیز اطلاعات دقیق مربوط به شرایط متابولیسمی باکتری از روی توالی نوکلئوتیدی استخراج شده و نیز تعدادی از مؤلفه های مولکولی جدید نیز در آن شناسایی گردیند.

کلیدواژه ها:

اکسترموفیل ، توالی یابی ژنوم Nesterenkonia sp. Strain F

نویسندگان

سجاد صاریخان

بانک مولکولی، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران، تهران- ایران

رضا آذربایجانی

بانک مولکولی، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران، تهران- ایران

لاله پارسا یگانه

بانک مولکولی، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران، تهران- ایران

محمدعلی آموزشگار

بانک میکروارگانیسم ها، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی زیستی ایران، تهران، ایران - آزمایشگاه اکسترموفیل، دپارتمان میکروبیولوژی، گروه زیست شناسی، دا

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Barrangou, R., Fremaux, C., Deveau, H., Richards, M., Boyaval, P., ...
  • Grissa, I., Vergnaud, G., Pourcel, C., 2007. The CRISPRdb database ...
  • Guo, F. B., Ou, H. Y., Zhang, C. T., 2003. ...
  • Lagesen, K., Hallin, P., Radland, E. A., Staerfeldt, H. H., ...
  • Lind, P. A., Andersson, D. I., 2008. Whole-genome mutational biases ...
  • Lowe, T. M., Eddy, S. R., 1997. tRNAscan-S. a program ...
  • Lukashin, A. v., Borodovsky, M., 1998. GeneMark. hmm: new solutions ...
  • Marraffini, L. A., Sontheimer, E. J., 2008. CRISPR Interference Limits ...
  • Marraffini, L. A., Sontheimer, E. J., 2010. CRISPR interference: RNA-directed ...
  • Rothberg, J. M., Leamon, J. H, 2008. The development and ...
  • نمایش کامل مراجع