بررسی بیوانفورماتیک بیان ژن های KAT2 و KAT1 تحت تنش شوری در گیاه آرابیدوبسیس

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,221

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0756

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

روزنه ها نقش مهمی در انتقال آب و دی اکسید کربن به گیاه دارند. باز و بسته شدن روزنه ها می تواند تحت تأثیر عوامل متعددی از جمله تنش شوری قرار گیرد. مشخص شده که دو پروتئین KAT1 و KAT2 بیشترین نقش را در ساختار و عملکرد سلول های نگهبان و کنترل تنش شوری دارند. بیان ژن KAT1 به منزله یک مسیر برای ورود پتاسیم و بازشدن روزنه ها و مهار فعالیت کانال KAT1 باعث بسته شدن روزنه ها می شود. به منظور مقایسه بیان ژنهای مذکور در حالت طبیعی و تحت تنش شوری و دربازه های زمانی متفاوت، از سایت (bbc.botany.utoronto.ca) e-FP Browser استفاده شد. به منظور بررسی هم بیانی ژن ها از الگوی رونویسی mRNA-Mrna و برهم کنش پروتئین- پروتئین استفاده و آانالیز داده ها با نرم افزار Minor calculation bug fix of ver. c4.0. از سایت مذکور انجام شد. بررسی الگوی هم بیان دو ژن KAT1 و KAT2 در ساقه نشان می دهد که الگوی بیان این ژن مشابه هم بوده ولی میزان بیان ژن KAT1 همواره از ژن KAT2 بیشتر است. در اندام ریشه بیان آنها کاملاً متفاوت بوده و ژن KAT2 نسبت به KAT1 بیان بیشتری دارد. با درنظر گرفتن این مسئله که هر دو ژن عملکرد مشابه دارند می توان گفت که KAT2 برای اندام ریشه و KAT1 برای اندام هوایی تمایز یافته است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مصطفی حق پناه

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قربانعلی نعمت زاده

استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

سیده فرزانه فاطمی

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری