همسانه سازی و تعیین توالی طول کامل cDNA ژن MYC2 در کلزا (B.napus)
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 672
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0799
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
ژن MYC2 یک عامل رونویسی کلیدی در مسیری وابسته به نورمون اسید آبسیزیک در گیاه آرابیدوپسیس است که بیان آن در شرایط تنش رطوبتی افزایش می یابد. بهره گیری مستقیم از اطلاعات ژنوم آرابیدوپسیس به منظور شناسایی ژن های مشابه در گونه های جنس براسیکا با استفاده از ارتباط نزدیک فیلوژنتیکی بین آرابیدوپسیس و کلزا ممکن شده است. این پژوهش با هدف جداسازی کامل ارتولوگ ژن MYC2 در کلزا (Brassica napus) انجام شد. با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده از ژن MYC2 در آرابیدوپسیس قطعه ای به طول 962 جفت نوکلئوتید در cDNA جداسازی و پس از همسانه سازی، توالی یابی گردید. پس از تأئید همولوژی بالای قطعه توالی یابی شده با ژن MYC2 در آرابیدوپسیس، با استفاده از پرایمرهای جدید و تکنیک RACE اندازه قطعه توالی یابی شده ژن MYC2 در کلزا در cDNA به 2062 جفت نوکلئوتید افزایش یافت. میزان شباهت توالی کامل cDNA و ORF ژن BnMYC2 با توالی کامل cDNA و ORF ژن AtMYC2 محاسبه شد که برابر با 78/7% و 81/4% می باشد. دامنه های موجود در تالی پروتئینی BnMYC2 با استفاده از Expasy تعیین شد. دامنه پروتئینی helix-loop-helix که در خانواده عوامل رونویسی MYC موجود می باد در پروتئین MYC کلزا نیز وجود داشت.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سمیه فنائی
دانشجوی کارشناس ارشد زیست فناوری، دانشگاه شیراز
هومن راضی
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتا دانشگاه شیراز
زهره حیدریان
استادیار بخش زیست فناروی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :