بررسی بیوانفورماتیکی اپی توپ های خطی پروتئین هماگلوتنین (HA) در ویروس آنفلوانزای H5N1

آنفلوانزای پرندگان یاH5N1 یکی از مهم ترین بیماری های عفونی پرندگان محسوب می شود. ژنوم ویروس آنفلوانزای Aبه صورت مولکول هایRNAقطعه قطعه و تک رشته ای منفی که پروتئین های زیادی را کد می کنند وجود دارد. پروتئین های سطحی مهم درویروس آنفلوانزا که مسئول بیماری زایی ویروس در انسان و پرندگان هستند، هماگلوتنین و نورامینیداز می باشند. پیش بینی اپی توپ های پروتئینی می تواند یک آنتی ژن ایمنی زای مناسب را جهت تشخیص ویروسAآنفلوانزایH5N1 فراهم کند. همچنین از اپی توپ های پیش بینی شده و تایید شده می توان به عنوان آنتی ژن مناسب در ساخت واکسن جهت کنترل پاندمی قریب الوقوع این پاتوژن استفاده نمود. اپی توپ های حفاظت شده می توانند جهت تشخیص حیوانات آلوده به ویروس آنفلوانزا مورد استفاده قرار گیرند و این امر درپیشگیری از پخش ویروس از حیوانی به حیوان دیگر و نیز جلوگیری از توسعه آن در مناطق جدیدتر موثر می باشد. اپی توپ ها به عنوان عامل تشخیصی یا به عنوان ایمونوژن حفاظتی در واکسن های جدید عمل می کنند. پپتیدهای شناسایی شده برای توسعه واکسن ها کاربرددارند زیرا زمان لازم برای انجام تست های مورد نیاز جهت یافتن اپی توپ های احتمالی که هدف تولید واکسن هستند را کاهش میدهند. تلاش برای کشف پپتید هایی که می توانند اپی توپ های پروتئین را تقلید و پاسخ ایمنی مشابهی با پروتئین کامل را ایجاد کنند بسیار حائز اهمیت می باشد .بنابراین روش های تئوری برای پیش گویی اپی توپ ها گسترش زیادی یافته است که منجر به سنتز پپتیدهایی شده که از نظر تست های تشخیصی ایمنی و نیز تولید واکسن اهمیت زیادی دارند. مطالعه حاضر برای کنترل و یا ممانعت از گسترش عفونت های ناشی از آنفلوانزای پرندگان طراحی شده است. در این تحقیق، آنالیز بیوانفورماتیکی زیر واحد بزرگHA 1 پروتئین هماگلوتنین ویروس آنفلوانزا از نقطه نظر تشخیص اپی توپ های اختصاصی آن انجام شده و از ابزار های بیوانفورماتیک برای مطالعه و توصیف بهتر ساختار این زیر واحد و نیز انتخاب نواحی مناسب به عنوان اپی توپ ویروس بهره برده شده است.

کلیدواژه ها:

آنفلوانزای پرندگان ، اپی توپ ، بیوانفورماتیک ، هماگلوتنین