آنالیز ژن پروتئین پوششی جدایههای ایرانی ویروس پیچیدگی شلغم

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 582

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0371

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

ویروس پیچیدگی شلغمTurnip curly top virus-TCTV)از اعضای جنس کورتوویروس از خانواده جیمنیویریده میباشد. این ویروس موجب بروز بیماری در برخی از گونههای زراعی و وحشی جنس براسیکا میشود. در بررسی بعمل آمده در سال 1392 تعدادی نمونهعلف هرز ترب وحشی با علائم بازماندند از رشد و پیچیدگی شدید برگ از استان تهران جمعآوری شده و احتمال آلودگی آنها به ویروسTCTVبا استفاده از روش پی.سی.آر و بکمک آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای تکثیر ناحیه ژن پروتئین پوششیTCTV (CP)مورد بررسی قرار گرفت. توالی قطعه دی.ان.ای تکثیر یافته طی آزمون پی.سی.آر تعیین شد. نتایج حاصل نشان داد که ژنCPجدایه ایرانی TCTV-Rapاز تربوحشیRaphanus raphanistrum 831 نوکلئوتید تشکیل شده که یک پروتئین فرضی بطول حدود 276 اسیدآمبنه را کد مینماید. جمعیت TCTVدر ایران به چهارر زیر جمعیتA,B,C,D تقسیم میگردد. بررسی آنالیز تنوعزحدر جمعیت جدایههای ایرانی این ویروس به روشKimura two parameterنشان داد که میزان تنوع کلی در این جمعیت0/072است. این اولین گزارش ازآنالیز توالی ژن پروتئین پوششی جدایههای این ویروس از میزبان علف هرز ترب وحشی در ایران میباشد.

نویسندگان

شیرین فرزادفر

بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران

رضا پوررحیم

بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bolok Yazdi, H.R., Heydarnejad, J., and Massumi, _ 2008. Genome ...
  • Briddon, R. W. Heydarnejad, J., Khosrowfar, F., Massumi, H., Martin, ...
  • Brown, J. K., Fauquet, C. M., Briddon, R. W., Zerbini, ...
  • Hall, T. A. (1999) BIOEDIT: _ user-friendly biological sequence alignment ...
  • Loconsole, G., Saldarelli, P., Doddapaneni, H., Savino, V., Martelli, G. ...
  • Razavinejad, S., Heydarnejad, J., Kamali, M.. Massumi, H., Kraberger, S. ...
  • Tamura, K., D., Peterson, N., Peterson, G., Stecher, M., Nei. ...
  • Zhang, Y. P., Uyemoto, J. K. and Kirkpatrick, B. C. ...
  • Plant Virus Research Dept., Iranian Research Institute of Plant Protection, ...
  • نمایش کامل مراجع