بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYB

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 540

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0410

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYBتوالی 10 آیزوفرم مختلف از آرابیدوپسیس از پایگاه NCBI تهیه شد که شاملMYB29 MYB28-2, MYB28-1, MYB27, MYB26, MYB25, MYB23, ,MYB22, MYB2 بودند کهتوسط برنامهGENE INFINITYمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج نشان داد که برای اکثر اسید آمینهها، کدونی ترجیح داده شده بودکه نوکلئوتید انتهایی آنAیاtبود و برعکس برای همان اسید آمینهها کمترین ترجیح برای کدونهایی بود که دارایcیاG درنوکلئوتیدآخر خود بودند. نتایج حاصل از تجزیه کلاستر نشان داد که در گروه اول که شاملMYB23, MYB29, MYB28-2, MYB28-1وMYB20بودند بین آیزوفرمMYB28- و 2 MYB28-1بیشترین تشابه ( 63,35 %) از لحاظ ترجیح کدونی وجود داشت در حالیکه در گروه دوم که شاملMYB27, MYB25 ,MYB26 ,MYB22 MYB2می شود و بین آیزوفرمMYB و 22 MYB2561 ) بیشترین تشابه از لحاظ ترجیح کدونی وجود داشت. بنابراین میتوان نتیجه گرفت که بین آیزوفرمهای مختلف این ژن از نظر ترجیح کدونی شباهت وجوددارد

کلیدواژه ها:

نویسندگان

محمود احمدی کردشولی

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات دانشگاه شیراز

علیرضا میرزایی

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات دانشگاه اردبیل

دنیا پوی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز، پژوهشکده بیوتکنولوژی

زهره حیدریان

استادیار دانشکده کشاورزی- دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • .Abscisic acid _ dependent multisite pho sphorylation regulates the activity ...
  • Ikemura, T. 1985. Codon usage and tRNA content in unicellular ...
  • Lorenzoand, O., Solano, R., 2005. Molecular players regulating the j ...
  • Ermolaeva, M.D. Synonymous codon usage in bacteria. 2001 Current Issues ...
  • Wain-Hobson, S., Nussinov, R., Brown, R.J. and Sussman, .J.L. 1981. ...
  • Furihata _ T., Maruyama, K., Fujita, Umezawaz z, Y. T., ...
  • نمایش کامل مراجع