موتیفهای محافظت شده در الکل دهیدروژناز

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,325

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0583

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

با هدف بررسی و شناسایی اسیدآمینههای مهم از نظر ساختاری و عملکردی که در طول تکامل محافظت شدهاند در خانوادهMD-الکل دهیدروژنازها، تجزیه و تحلیل کامپیوتری پیشرفتهای بر روی توالی و ساختار سه بعدی این آنزیمها صورت گرفت. آنالیزتوالی با توجه بهبرخی خصوصیات اسیدهای آمینه از جمله همسانی، تشابه، انتروپی، هیدروفوبیسیتی برای تعیین سطح محافظت شدگی در هر جایگاه انجامشد. در این مطالعه دو منطقه کاملاٌ محافظت شده که الگوی مشخصی را در توالی خود در طول تکامل حفظ کردهاند، مشخص شدند. به نظر میرسد این موتیف ها در تغییر آرایش فضایی آنزیم بعد از اتصال به سوبسترا یک نقش مکانیکی به عنوان لولا داشته باشند

نویسندگان

شمیلا درویشعلیپور

گروه بیوانفورماتیک، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

زرین مینوچهر

گروه بیوانفورماتیک، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

مهران میراولیایی

دانشکده زیست شناسی، دانشگاه اصفهان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Valdar, W.S., 2002, Scoring residue conservation. Proteins, . 48(2): p. ...
  • Kim, S.J., et al., 2004, Functional reclassification of the putative ...
  • Chothia, C., I. Gelfand, and A. Kister, 1998, Structural determinants ...
  • Guy, J.E., M.N. Isupov, and J.A. Littlechild, 2003, The structure ...
  • Riveros -Rosas, H., et al., 2003, Diversity, taxonomy and evolution ...
  • Bairoch, A. and R. Apweiler, 2000, The SWISS-PROI protein sequence ...
  • Berman, H.M., et al., 2000, The Protein Data Bank. Nucleic ...
  • Tamura, K., et al., 2007, MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis ...
  • Eddy, S.R., 1998, Profile hidden Markos models. Bioinformatics, _ 14(9): ...
  • WR.Taylor, 1986, The classification of amino acid conservation. J TheorBiol, ...
  • Schneider, T.D. 1997, Information content of individual genetic sequences. J ...
  • Grant, B.J., et al. 2007, Multivariate analysis of conserved sequence- ...
  • Mirny, L. and E. Shakhnovich, 2001, Evolutionary conservation of the ...
  • Grant, B.J, et al., 2006, Bio3d: an R package for ...
  • Hayward, S., 1999, Structural principles governing domain motions in proteins. ...
  • Humphrey, W., A. Dalke, and K. Schulten, 1996, VMD: visual ...
  • Department of Biology, University of Isfahan minuchehr@ nigeb. ac.ir, ...
  • نمایش کامل مراجع