بهینه سازی روش های تعیین غلظتDNAباطراحی روش تکثیرDNA

در زمینه ی علوم پزشکی ، در صحنه هایی که شواهد محدود و تجدیدناپذیر و یا ممکن است تخریب شده باشند و یا شامل مهار کننده واکنشPCRباشد اندازه گیری مقدارDNAاستخراج شده از صحنه ی جرم، گامی اساسی در ایجاد نتایج بهینه ، می باشد .همچنین واکنش پی سی آر به مقدارDNAالگوی ورودی وابسته می باشد زیرا بازده ی فرایندPCRبه کیفیت ، خلوص و مقدارDNAانسانی موجود در نمونه بستگی داردتعیین غلظتDNAمورد نظر در تشخیص زود هنگام بسیاری از بیماری ها از جمله تشخیص زود هنگام سرطان پروستات در مرحلهD1موثراست. طی این پروژه ابتدا یک توالیDNAکه تکرار آن در ژنوم انسانی زیاد باشد را انتخاب نموده که این توالی ازSINE ya5ALUبه دلیل تکرارزیاد آن در ژنوم انسانی انتخاب گردید. سپس پرایمرهای مربوطه را طراحی نموده و دمای ذوب، آنلینگ، درصدCGو طول هر یک از پرایمرها با استفاده از نرم افزار تخمین زده شده و نیز پرایمرها از نظرheterodimer و hairpin و self dimerبررسی می شوند. در این تحقیق دردماهاوغلظت های مختلفی از منیزیم فرایندpcrبر روی پرایمر انجام شد که نتایج آن توسط الکتروفورز بررسی گردید. با توجه به نتایج آزمایش طول قطعهbp150 بود که با قطعه ی طراحی شده هم خوانی داشت

کلیدواژه ها:

توالیDNA ، پرایمر ، پی سی آر ، آرتی پی سی آر ، اندازه گیری کمی