استفاده از الگوریتمهای القای درختهای تصمیم برای جداسازی ژنوتیپهای ویروس هپاتیت سی

هپاتیت سی یک بیماری التهابی نکروز دهنده کبد است که به صورت حاد و مزمن بروز مینماید. این ویروس دارای 6 ژنوتیپ است که 4ژنوتیپ آن گسترش جهانی داشته و ژنوتیپهای 5 و 6 در مناطق خاصی از دنیا دیده میشوند. هزینه یک دوره درمان بیماری با داروهاینسل جدید به 60 تا 80 میلیون تومان بالغ شده که پاسخ به درمان بر اساس نوع ژنوتیپ ویروس متفاوت می باشد. بنابراین تشخیص نوعژنوتیپ ابتلایی در مورد ویروس هپاتیت، قدم اول در تعیین پروسه درمانی می باشد. این مطالعه جهت تشخیص نوع ژنوتیپ براساس الگوهای تکرارشونده میباشد. روش: توالی ژنومی 742 ویروس هپاتیت سی بر اساس دو ژنوتیپ 1 و 2 تهیه شده و بانک اطلاعاتی بر اساس الگوهای 20 تاییاستخراج گردید. از 8 مدل آماری وزندهی و 3 الگوریتم تصمیم جهت تعیین متغیرهای مهم بر اساس توالیهای ژنومی 20 تایی درشناسایی ژنوتیپ 1 و 2 استفاده گردید نتیجهگیری: یافتههای مطالعه نشان داد که 4 متغیر،AAGAAAAACCAAAAGAAACA ،CAAAGAAAAACCAAAAGAAA,AAGACTGGGTCCTTTCTTGG و ATGAGCACAAATCCTAAACCمیتوانند به عنوان متغیرهای کلیدی در تشخیص نوع ژنوتیپ ابتلائی بهکار برده شوند

کلیدواژه ها:

ویروس هپاتیت سی ، ژنوتیپ ، درخت تصمیم ، بیومارکر ژنومی