بررسی الگوی بیانیRNA غیرکدکننده بلندROR در طی تمایز عصبی سلول های بنیادی و تایید آزمایشگاهی وجود یکmiRNAبالقوه مستقر در اینترون دومROR

گروه جدیدی از ژن های شناخته شده در ژنوم انسانRNAهای غیرکدکننده بلند بین ژنی هستند که کنترل کننده فرآیند های مختلف زیستی از جمله حفظ پرتوانی سلول های بنیادین و نورون زایی هستندLinc-RORژن جدیدی است که در بازبرنامه نویسی سلول نقش دارد. در این مطالعه بیان این ژن را در حین تمایز سلول های بنیادین جنینیNT2به سلول های عصبی بررسی کردیم. همچنین با استفاده از نرم افزارهای مختلف ناحیه کروموزومی این ژن را برای امکان وجود واریانت های احتمالی و ساختارهای ساقه حلقه مورد بررسی دقیق تر قرار دادیم. نتایج حاصل ازReal-time PCRنشان دادند که بیان این ژن هم راستا با فاکتورهای کلیدی پرتوانی سلول های بنیادین از روز سوم پس از تمایز کاهش می یابد و در روز 32 پس از تمایز پایین ترین سطح بیان را دارد. با توجه به آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای نواحی cDNAاین ژن پرایمر طراحی شد. با استفاده ازRT-PCRو تعیین توالی مستقیم چهار واریانت جدید این ژن شناسایی شد که در سلول های مختلف بیان متفاوت دارند. همچنین نتایج آنالیزهای بیوانفورماتیکی این ناحیه حاکی از وجود یک ساختارحفاظت شده ساقه- حلقه ای در اینترون دوم این ژن که پتانسیل تولیدmiRNAرا داردکلونینگ و پیش بیان این ناحیه باعث تغییرات شدیدی در سیکل سلول و بقای سلول های ترانسفکت شده شد. در مجموع نتایج ما نشان دهنده نقش کلیدی این ژن و واریانت های ان در حفظ سلول های بنیادین و تمایز سلولی است

کلیدواژه ها:

پرتوانی ، پیشگوییmiRNA ، تمایز عصبی ، RNAهای غیرکدکننده بلند بین ژنی ، Linc-ROR