بررسی روابط تکاملی و فیلوژنی پروتیینهای خانواده دهیدرین در گیاهان

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,751

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0991

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

پروتیینهای گروه دهیدرینDehydrin: DHNگروهی از پروتیینهای مهم دخیل در پاسخ به تنشهای غیرزیستی مانند سرما، شوری و خشکی در گیاهان می باشند. این پروتیینها به گروهی از پروتیینهای محافظت کننده از سایر پروتیینها به نامLate type IIembryogenesis abundantتعلق دارند. با توجه به اهمیت پروتیینهای گروه دهیدرین، در این تحقیق روابط تکاملی این گروه درگیاهان مختلف مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور توالیهای پروتیینهای دهیدرین گیاهان مختلف از سایتNCBIاستخراج وهمردیف گردید. نتایج وجود نواحی حفاظت شده از جمله موتیفS و Kکه به ترتیب در واکنش با سایر پروتیینهای تحت تنش ومحافظت از آنها و همچنین انتقال پروتیینهای گروه دهیدرین از سیتوپلاسم به هسته نقش دارند را در بین ژن های مورد بررسی نشان داد سپس درخت فیلوژنی بر اساس نواحی حفاظت شده و با روشNeighbor Joiningرسم گردید. پروتیینهای گروه دهیدرین دو لپهای و تکلپهایها به دو گروه مجزا تفکیک شده و در هر گروه نیز بر اساس نزدیکی و دوری جنسهای مختلف گیاهی در کلاسترهای مجزا قرار گرفتند. بعلاوه، پروتیین های دهدرین متعلق به دو گونه آتریپلکس، که می توانند خشکی بسیار شدید را تحمل کرده و نیز در مناطق با شوری زیاد رشد کنند، با فاصله از دو گروه دو لپهای و تکلپهایها در یک گروه مجزا قرار گرفتند.

نویسندگان

الهه توکل

استادیاربخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

آرمین ساعدموچشی

دانشجوی دکتری بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Borovskii, _ Stupnikova, I., Antipina, A., Vladimirova, S., & Voinikov, ...
  • Chang-Cai, L. (2012). Genome-wide Identification and Ch aractereization of a ...
  • Close, T.J., Kortt, A.A., Chandler, P.M. (1989). A cDNA-based comparison ...
  • Hanin M., Brini F., Ebel C., Toda Y., Takeda S. ...
  • Jean, D., Mario, H., Jbic, R., & Fathey, S. 1994. ...
  • Saavedra, L, Svensson, J., Carballo, V., Izmendi, D., Welin, B., ...
  • _ Velas co-Conde, T., Yakovlev, I., Majada, J., Aranda, I., ...
  • Yang Y, He M, Zhu Z, Li S. Xu Y, ...
  • نمایش کامل مراجع