ارزیابیin silicoقطعات هیبرید شدهShET-1-ShET-2 و ناحیهN-انتهایIpaD از شیگلا فلکسنری 2a برای کاربرد در ایمنی زایی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 531

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_1080

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

اهداف و فرضیات: روش های بیوانفورماتیکی ابزار های بسیار مناسبی به منظور کشف و طراحی واکسن های پروتئنی زیر واحدی جدید و نیز بهبود واکسن های موجود می باشند. انتروتوکسین های شیگلاShETs که توسط برخی از گونه های شیگلا تولید می گردند، مسئول ترشح مایعات به روده و نیز پیشرفت اسهال در بیماران می باشند. محصولات ژن های رمز کننده انتروتوکسین های شیگلا فلکسنر ی2a که بر روی ناحیهSHI-1قرار گرفته اند در ایجاد فنوتیپ تهاجمی باکتری نقش کلیدی بازی می کنند. طراحی و ساخت واکسن های زیر واحدی به منظ ور تخفیف حدت بیماری زایی در برابر شیگلا فلکسنری2aضروری به نظر می رسد مواد و روشها: در این مطالعه، یک سازه ژنی مصنوعی بر اساس دو ناحیه باز ترجمهorf شامل set1B و set1Aدر لکوس ژنیShET1 و ژنShET2 و نیز ناحیه انتهاییN در ژنipaDطراحی گردید. کدون های سازه ژنی بر مبنای میزبان تخصصی مخمرPichia pastorisبهینه سازی و با استفاده از یک تکرار چهار تایی از پنج آمینواسید هیدروفوبیک به عنوان لینکر الحاق انجام شد. ساختمان سازه ژنی سنتزی از جهت ساختار دومmRNAو نیز پایداری پروتئین کایمریک آن با استفاده از نرم افزار های بیوانورماتیک مورد آنالیز قرار گرفت. همچنین ایمنی زایی پروتئین نوترکیب مولتی مر که شامل سه دومین متفاوت می باشد پیش بینی گردید.نتیجه گیری: یک مدل ساختاری از یک ژن مصنوعی سنتزی که شامل انتروتوکسین و پروتئین ماشین تهاجمی شیگلا فلکسنری2a ارائه گردید. این سازه قابلیت دسترسی، حلالیت و ایمنی زایی مناسبی می تواند داشته باشد.

نویسندگان

سمیه چاووشی

مرکز تحقیقات ژنتیک انسانی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)، تهران، ایران

محمود تولایی

مرکز تحقیقات ژنتیک انسانی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)، تهران، ایران

سیدمصطفی حسینی

مرکز تحقیقات ژنتیک انسانی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)، تهران، ایران