مطالعه ترادف دامینPEP-utilizer-C درآنزیم پیروات ارتوفسفات دی کینازPPDK گیاه آلوروپوس لیتورالیس

تجدید فسفوانول پیرواتPEP بعنوان اولین پذیرندهCO2 در استرومای سلول های مزوفیل کلروپلاست از اهمیت بالایی در چرخه فتوسنتزیC4 برخوردار است و تحت کنترل آنزیم پیرووات ارتوفسفات دی کینازPPDK می باشد. این آنزیم واکنش سنتز فسفوانول پیروات را با استفاده ازATPو پیروات انجام می دهد و به مقدار زیادی در برگ گیاهانC4وجود دارد و بیش از 10 درصد جزء محلول پروتئینی را تشکیل می دهد. دامینTIM barrel domain) PEP-utilizer-C بطول تقریبی 340 رزیدو در بخش کربوکسیلی آنزیم قراردارد و دارای جایگاه اتصال به پیروات/ فسفوانول پیروات می باشد. در این مطالعه بمنظور بررسی و مقایسه جایگاه های فعال، بخشی ازتوالی کد کننده دامینPEP-utilizer-Cاز گیاه آلوروپوس لیتورالیس جداسازی و برای آنالیز ترادف استفاده گردید. نتایج نشان داد که قطعه تکثیر شده یکORFبطول 162 رزیدو را رمز می کند و مشابهت معنی داری (بیش از 90 درصد) با سایر آنزیم های همولوگ در سطح پروتئینی دارد. بر این اساس حداکثر تشابه به ترتیب با گونه هایCyrtococcum patens , Eragrostis tenuifolia ,Eleusine indica و ذرت بدست آمد. تشخیص دامین با استفاده از پایگاهpfamتایید کرد که ترادف ترجمه شده بخشی از دامینPEP-utilizer- C می باشد. سپس تمام رزیدوهای شرکت کننده در اتصال به سوبسترا شامل 635,،844، 843 ، 692,845 و همچنین جایگاه فعال 907 نیز بدون تغییر در مقایسه با سایر آنزیم های همتا شناسایی گردید. همچنین محل اتصال منیزیوم در رزیدوهای شماره 821 (گلوتامیک اسید) و 845 (آسپارتیک اسید) در این ترادف مشخص شد. این نتایج نشان داد که کلیه رزیدوهای درگیر در کاتالیز و اتصال بشدت بین گیاهانC4 و 3 C حفاظت شده اند. در نهایت مقایسه ساختار دوم و هیدروفوبیته دامینPEP-utilizer-CآنزیمPPdkگیاه آلوروپوس باسایرآنزیم های مشابه کلروپلاستی و سیتوپلاسمی سطح بالایی از حفاظت شدگی را نشان داد

کلیدواژه ها:

آنزیم پیروات ارتوفسفات دی کیناز ، دامینPEP-utilizer-C ، آلوروپوس لیتورالیس