بررسی بیوانفورماتیکی ژن 1-دئوکسی-دی -زایلوز 5-فسفات سنتاز در چندین گونه گیاهی به منظور جداسازی ژن در پیرتروم

ژن 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز 1یک ژن کلیدی در مسیر بیوسنتزی ایزوپرنوئیدها 2 می باشد که این ژن در مسیرMEPبا استفاده ازپیروات و گلیسر آلدهید 3 -فسفات باعث تولید 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات 4 می گردد. با توجه به اهمیت بالای ایزوپرنویید ها بررسی وشناخت بیشتر این متابولیتها حائز اهمیت میباشد. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی توالی نوکلوتیدی مربوط به ژن مزبور وطراحی آغازگر به منظور جداسازی این ژن در گیاه پیرترومcinerariaefolium Chrysanthemum)از خانواده گل ستاره ای ها 5 میباشد در این تحقیق ابتدا توالی های نوکلوتیدی آنزیم 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز از پایگاه اطلاعاتیNCBIدریافت شد و سپس توالی های دریافت شده توسط نرم افزار تحت وبClustalWهمردیف شدند و درخت فیلوژنی آن توسط نرم افزارMEGA4رسم و مورد بررسی قرار گرفت. از همردیف سازی توالی های بدست آمده برای این توالی در گیاه پیرتروم آغازگرهای ویژه مستقیم و معکوس طراحی و ساخته شد. نتایج واکنش زنجیره ای پلیمراز و مشاهده باند با طولbp715 نشان داد که آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای جداسازی ژنDXSکارایی لازم را دارند.

کلیدواژه ها:

جداسازی ژن ، همردیفی ، 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز ، پیرتروم