پردازش ژل های الکتروفروسیس پروتئین و DNA با تحلیل تصویر

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,710

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CITCONF02_009

تاریخ نمایه سازی: 19 اردیبهشت 1395

چکیده مقاله:

با قوانین جدید امکان ثبت گونه های جدید و تحلیل ژلهای الکترو فروسیس پروتئین و DNA با تحلیل تصویری برای شناسایی گونه ها اهمیت یافته اند. بخش های DNA یا پروتئین با زون های ملکولی متفاوت با استفاده از الکتروفروسیس تفکیک شده اند و یک سری از آن ها را با موقعیت های مربوط به وزن ملکولی ارائه داده اند. تحلیل تصویر ژل ها اکثر موضوعیت مقایسه دوجانبه موقعیت باند و شدت بین نمونه را از بین می برد. اولین قدم اصلاحات پردازش برای تقسیم ژئومتریک را لبخند زدن می نامم که تحت تأثیر تمدن بشری در طول الکتروفروسیس حاصل می شود. اکثر نقایص لبخند زدن ممکن است با شناسایی و مستقیم سازی یک جفت باند (هر یک در یک انتهای کوچه) حذف شوند که برای اکثر مسیرها عمومیت داشته و مشترک است. سپس مسیرهای فردی مربوط به همه مون به طور خودکار شناسایی می شود و مه زمینه تخمین زده شده و با کسب آن از تصویر از میان برداشته می شود. آن ها سپس شناسایی شده و موقعیت و شدت آن ها در هر باند تعیین می شود. با استفاده از یک سر پروتئین یا نوکلئوتید با وزن های مولکولی شناخته شده در یکی از مسیرها و استفاده از وزنه های مالک روی مقوله بانک ها در هر نمونه قادر به تخمینی مبتنی بر موقعیت آن ها می باشد. استفاده از روش های تحلیل پستی در این کار می تواند روش ارزان و سریع نسبی از شناسایی هدفمند اختلاف بین نمونه ها را فراهم سازد.

نویسندگان

محسن فیروزآبادی

دانشجوی کارشناسی ارشد،گروه کامپیوتر ،دانشگاه آزاد واحد سیرجان،ایران

آرش عزیزی مزرعه

گروه مهندسی کامپیوتر ،واحد سیرجان ،دانشگاه آزاد سیرجان،ایران

صادق حاج محمدی

گروه مهندسی کامپیوتر ،واحد سیرجان ،دانشگاه آزاد سیرجان،ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Williams C.E and St. Clair D.A. Phenetic relationships and levels ...
  • " Natinal Conference on Applied Research in Computer Science and ...
  • polymorphic DNA analysis of cultivated and wild accessions of Lycopersicon ...
  • Shapiro A.L, Vineula E., Maizel J. V. Molecular weight estimation ...
  • Weber K. and Osborne M. The reliability of molecular weight ...
  • Aaij C. and Borst P. The gel electrophoresis of DNA. ...
  • Meyer J.A., Sanchez D., Elwell L.P. and Falkow S Simple ...
  • Southern E.M Measuremen of DNA length by gel electrophoresis. Analytical ...
  • Plikaytis B.D., Carlone G.M., Edmonds P. and Mayer L.W. Robust ...
  • Owen R.J. and Beck A. Evaluation of three procedures using ...
  • Applied Microbiology 4:5-8 (1987) ...
  • نمایش کامل مراجع