خوشه بندی داده های بیان ژنی به یک روش فازی

داده کاوی به منظور کشف نمونه های مهم و ناشناخته از میان حجم وسیعی از داده ها استفاده می شود. خوشه بندی از محبوب ترین روش های کشف اطلاعات در داده کاوی به حساب می آید. تکنیک ریز ارایه ها میزان بیان ژن ها در طول آزمایشات زیست شناسی مهم را در مقابل مجموعه از نمونه های مرتبط به صورت هم زمان نشان می دهد. به دلیل تعداد زیاد ژن های کشف شده و پیچیدگی شبکه های زیست شناسی چالش های زیادی در رابطه با تحلیل داده های بیان ژنی وجود دارد. قدم اول برای رویارویی با این چالش ها، استفاده از الگوریتم خوشه بندی می باشد که دارای کاربردهای فراوانی در زمینه داده کاوی است. مطالعات قبلی نشان می دهند روش های خوشه بندی فازی برای داده های بیان ژنی بهتر از روش های خوشه بندی غیر فازی می باشد زیرا خوشه های ژنی ذاتا دارای هم پوشانی می باشد. در این مقاله از روش AFCM جهت خوشه بندی داده های بیان ژنی به همراه روش K-Means به منظور کاهش تعداد ژن ها استفاده شده است. در قسمت نتایج نیز دقت اجرای الگوریتم بر روی چند مجموعه ریز ارایه با استفاده از چند معیار کارایی اندازه گیری شده و با دو روش خوشه بندی دیگر مقایسه صورت گرفته است.

کلیدواژه ها:

داده های بیان ژنی ، A9FCM ، ریزآرایه