بررسی پارامترهای RMSD و سطح قابل دسترس حلال در مدلسازی برهمکنش لیگاندهای Flavin Niacin ،Ibuprofen mononucleotide با آنزیم پالمیتویل کو آنزیم A هیدرولاز
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,253
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CMRCE03_340
تاریخ نمایه سازی: 13 دی 1390
چکیده مقاله:
طراحی و ساخت مهارکننده های موثر برای غیرفعال کردن آنزیم پالمیتویل کوآنزیم A هیدرولاز و مطالعه برهمکنش این آنزیم با مهارکننده ها با استفاده از روشهای محاسباتی در ارائه مدلی قابل قبول برای عملکرد میزان موثر بودن مهرکننده ها و نیز ارایه مکانیزمی برای عمل مهارکننده ها در رسیدن به مهارکنندگان موثرتر مفید و راه گشا خواهد بود در تحقیق حاضر اثر تعداد 3 مهارکننده به نامهای fmn وایبوپروفن، نیاسین برروی انزیم پالمیتوئیل کوآ با کد 3.1.2و2 و با استفاده از روش محاسباتی دینامیک مولکولی شبیه سازی و مطالعه گردید. شبیه سازی در شرایط شبیه شرایط فیزیولوژیک یعنی در محیط آبی درجه حرارت 37 درجه و فشار یک اتمسفر انجام گردید بعد از انجام دینامیک مولکولی پارامترهای مورد نیاز از فایل مسیر شبیه سازی استخراج و آنالیز نتایج انجام شد. مهارکننده فلاوین مونونوکلئوتید FMN با کاهش میزان ساختار نامنظم وافزایش ساختارهای منظم آلفا و بتا ضعیف ترین مهار کننده شناخته شدند.
کلیدواژه ها:
آنزیم پالمیتویل کوآنزیم A هیدرولاز ، مهارکننده ، دینامیک مولکولی ، RMSD انحراف معیار جذب میانگین مربعات اسکلت پروتئین
نویسندگان
فاطمه دیالمه پور
گروه شیمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد شوشتر
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :