بهبود الگوریتم ژنتیک برای حل مسئله پیشبینی ساختار پروتئین

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,016

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CSITM01_287

تاریخ نمایه سازی: 10 شهریور 1393

چکیده مقاله:

بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از الگوریتم ها، نرم افزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی می گردد تا بهمسائل بیولوژیکی، بخصوص در زمینه های سلولی و مولکولی پاسخ داده شود. پیش بینی ساختار پروتئین از جمله مسایل پیچیده ومهم علم بیوانفورماتیک است و تاکنون تحقیقات گستردهای برای حل این مساله با استفاده از الگوریتم های تکاملی از جملهالگوریتم ژنتیک صورت گرفته است. در این مقاله، به منظور افزایش دقت پیش بینی ساختار پروتئین، برای اولین بار از عملگرهمبری مبتنی بر ماسک الگو در الگوریتم ژنتیک استفاده شده است. نتایج حاصل از اجرای الگوریتم پیشنهادی ما بر روی پنجدنباله آزمون استاندارد (مورد استفاده در بسیاری از تحقیق های دیگر) نشان می دهند که استفاده از عملگر همبری مبتنی بر ماسکالگو در الگوریتم ژنتیک، می تواند به طور قابل توجهی دقت پیش بینی ساختار پروتئین را نسبت به الگوریتم های مشابه قبلی بهبودبخشد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

آرش مزیدی

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه شیراز

نجمه سعید

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه شیخ بهایی

نیلوفر مزیدی

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه پیام نور علی آباد کتول

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • - Hoque, Md Tamjidul., Chetty, Madhu., Lewis, Andrew., Sattar, Abdul., ...
  • - Lesk. Arthur. (2013); Introduction o bioinformatics. Oxford University Press. ...
  • - Wang, Jason TL, Zaki, Mohammed J., Toivonen, Hannu TT., ...
  • - Berger, Bomnie, . Leighton, Tom. (1998); "Protein Folding in ...
  • Unger, Ron., Moult, John. (1993); "Genetic algorithms for protein folding ...
  • - Lau, Kit Fun., Dill, Ken A. (1989); "A lattice ...
  • - Tantar, A-A., Melab, Nouredine., Talbi, E-G., Parent, Benjamin., Horvath, ...
  • - Cutello, Vincenzo., Nicosia, Giuseppe., Pavone, Mario., Timmis, Jonathan. (2007); ...
  • - Unger, Ron. (2004); "The genetic algorithm approach to protein ...
  • - Van Regenmortel. M. H. V. (1989); "The concept and ...
  • Hart. W and Newma. A. (2001); Protein Structure Prediction with ...
  • - Sharapov, R. (2007); "Genetic Algorithms: Basic Ideas, Variants and ...
  • - Hart, W, E., Istrail, S. (2005); _ Benchmarks", http ...
  • - Lesh, Neal., Mitzenmacher, Michael., Whitesides Sue. (2003); "A Complete ...
  • نمایش کامل مراجع