تاثیر اندازه جمعیت بر معنی‌داری تست‌های Neutrality در مطالعه دینامیک جمعیتی جنس خاویاریAcipenser

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 576

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ESPME03_636

تاریخ نمایه سازی: 25 اسفند 1392

چکیده مقاله:

چندین تست آماری برای شناسایی تاریخ دموگرافیک و بررسی اثرات انتخاب طبیعی بر جمعیت‌های گونه‌های مختلف توصیف شده‌اند. تست Tajima's D از توزیع فرکانس جهش‌های نوکلئوتیدی و تست Fu's Fs از توزیع هاپلوتایپ‌ها برای شناسایی تاریخ دموگرافیک جمعیت‌ها استفاده می‌کنند. هدف این مطالعه بررسی اثر اندازه جمعیت بر معنی‌داری این تست‌ها می‌باشد. بدین‌ منطور سکانس‌های سه ژن میتوکندریایی شامل D-Loop، Cyt b و 18S rRNA مربوط به سه گونه از جنس Acipenser از طریق GenBank و داده‌های منتشر شده در مطالعات پیشین بدست آمد و برای آنالیز استفاده شد. مقادیر D تست Tajima's و مقادیر Fs تست Fu's برای هر ژن در هر سه گونه با هفت اندازه‌ جمعیت متفاوت با استفاده از بسته نرم‌افزاری Arlequin 3.5 محاسبه و از معنی‌داری آنها اطمینان حاصل شد. بعلاوه، پارامترهای اساسی تنوع مولکولی محاسبه شد. نتایج نشان داد که با کاهش اندازه جمعیت، معنی‌داری هر دو تست بطور چشمگیری کاهش می‌یابد. بعلاوه، نتایج نشان داد که تست Fu's Fs برای اندازه جمعیت‌های کوچک و تست Tajima's D برای اندازه جمعیت‌های بزرگ‌ کاراتر می‌باشد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فتاح زارعی

دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم زیستی گروه زیست شناسی جانوری

حسین سمیعی اصفهانی

دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم زیستی گروه زیست شناسی جانوری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Tajima, F., Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis ...
  • Tajima, F., The effect of change in population size on ...
  • Slatkin, M. and R.R. Hudson, Pairwise comparisons of mitochondriat DNA ...
  • Fu, Y.-X., Statistical tests of neutrality of mutations against population ...
  • Rogers, A.R. and H. Harpending, Population growth makes _ in ...
  • Brown, W.M., et al., Mitochondriat DNA sequences of primates: tempo ...
  • Wilson, A.C, et al.. Mitochondriat DNA and two perspectives on ...
  • Avise, J.C., Phylog eography: the history and formation of species2000: ...
  • Birstein, V.J., P. Doukakis, and R. DeSalle, Polyphyly of mtDNA ...
  • Ciftci, Y., O. Eroglu, and _ Firidin, Mitochondriat Cytochrome b ...
  • Birstein, V.J., et al., The enigmatic Caspian Sea Russian sturgeon: ...
  • Chelomina, G., et al. Multiplicity of alleles of nuclear 18S ...
  • D avoudi -Dehaghani, E., et al., Mitochondriat DNA sequence diversity ...
  • Excoffier, L., G. Laval, and S. Schneider, Arlequin (version 3.0): ...
  • نمایش کامل مراجع