شناسایی ملکولی گونه های استرپتومایسس دارای خواص آنتی باکتریال بر اساس ژن 16 به روش شبه آشیانه ای SrDNA

مقدمه : یکی از روشهای دقیق شناسایی گونه های باکتریایی تکنیک های مولکولی است . با توجه به اینکه تستهای بیوشیمیایی ومشخصات مورفولوژیک کلنی برای شناسایی دقیق استرپتومایسس زمان بر و مبهم است هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی استرپتومایسس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی در خاک منطقه گرمساربود . مواد وروش ها : در این مطالعه مقطعی 176 ایزوله جداسازی شد . که پس ازانجام روشهای بیوشیمیایی ایزوله های دارای خواص آنتی باکتریال ایزوله ها با استفاده از کیت تجاری صورت پذیرفت . سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و تکثیر ژن DNA شناسایی شدند . استخراج تعیین توالی گردیدند . PCR انجام گرفت و 10 نمونه از محصولات ، (Semi-Nested ) 16 ، به روش SrDNA در 43 جدایه باند اختصاصی PCR 26 ) درصد دارای خواص آنتی باکتریال بود . که پس از انجام /14) یافته ها : از 176 ایزوله بدست آمده 46E تنها 9 باند اختصاصی ایجاد شد . ولی در مرحله بعد از دو پرایمر B و F استرپتومایسس بدست آمد . در مرحله اول با استفاده از دو پرایمرکه به روش شبه آشیانه ای معروف است حساسیت افزایش یافت و در 43 ایزوله باند اختصاصی حاصل شد . بعد از شناسایی 10 جدایه ، B ومنتخب دارای فعالیت آنتی باکتریال انتخاب شد . پس از تعیین سکانس تمامی جدایه ها متعلق به جنس استرپتومایسس بودند ولی بدلیل گونه جدیدی شناسایی نشد . (NCBI) قرابت بالای نتایج سکانس های حاصل با سکانس های ثبت شده در بانک جهانی ژن نتیجه گیری : در حال حاضر بهترین روش برای شناسایی گونه های جدید از نمونه های مختلف خاک روش مولکولی است . استفاده از ژن 16 که یکی از محافظت شده ترین ژن های سلولی با حداقل تغییرات در تمام سلول هاست روشی کارآمد درشناسایی سویه های s rDNA جدید استرپتومایسس می باشد . یافته جالب توانایی بالای روش شبه آشیانه ای در شناسایی مولکولی استرپتومیستها بود . جهت شناساییسویه های بومی جدید نمونه های بیشتری باید مورد بررسی قرار گیرد

کلیدواژه ها:

16s rDNA: ، استرپتومایسس ، آنتی باکتریال ، شبه آشیانه ای