مهندسی معکوس شبکه های تنظیمی ژنی برپایه داده های زمانی ریزآرایه DNA و الگوریتم فوق اکتشافی جستجوی هارمونی

آگاهی از فرایند تنظیم ژن چه در سلولهای سالم و چه ناسالم می تواند اطلاعات ارزشمندی را در اختیا ر پزشکان و دانشمندان زیست شناس جهت درمان بیماریها قرار دهد و علل یا عوامل اصلی بیماری ها را مشخص کند. با بررسی میزا ن بیا ن ژن در نقاط زمانی متوالی و تحت شرایط مختلف می توان اثرات ژن ها و شبکه تعاملی آنها را تا حد زیادی مدلسازی و پیش بینی کر د. در این مقاله به منظور مدلسازی شبکه تعاملی ژنی بر اساس داده های ریز آرایه از مدل معادلات دیفرانسیل Recurrent Neural Network(RNN) و الگوریتم بدیع جستجوی هارمونی, Harmony Search Algorithm(HAS) بر پایه نمونه گیری نرمال برای آموزش و تخمین پارامترهای شبکه استفاده شده است.مدلسازی بر روی ریزآرایه DNA چرخه سلولی مخمر انجام گرفته است.نتایج مدلسازی حاکی از دقت بالای مدل دارد.

کلیدواژه ها:

مدل معادلات دیفرانسیل ، مد لسازی شبکه تنظیمی ژنی