رویکرد بیوانفورماتیک برای تولید فیوژن پروتئین کایمریک اپسیلون بتا clostridium perfringens و بیان آن در Escherichia
محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 995
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBIS04_106
تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393
چکیده مقاله:
فن آوری فیوژن پروتئین یک استراتژی کارآمد با صرفه اقتصادی و پرسرعت برای بیان پروتئین است. باکتری های جنس Clostridium از گروه باکتری هایبی هوازی هاگزا هستند. توکسین های اپسیلون و بتا Clostridium perfringens از توکسین های قوی کلستریدیائی به شمارمی آیند که می توانند بیماریهای کشنده ای را در دام تولید کنند. مقاله حاضر فیوژن آزمایشگاهی(in silico) ژن های اپسیلون و بتا کلستریدیوم پرفرینجنز تیپ های D و B را که برایکلونینگ در E.coli استفاده شده اند مورد بررسی قرار می دهد. ژن های اپسیلون (etx) و بتا (cpb) از بانک ژن بدست آمد و فیوژن ژن مورد نیاز برایتولید فیوژن پروتئین کایمریک طراحی گردید. فرمول (5–2 = A(EAAAK)nA (n که در آن توالی AEAAAK تکرار می شود برای طراحی رابط استفادهشد و ژن های اپسیلون و بتا با استفاده از این رابط به یکدیگر فیوز شدند. رمز توالی های اسید آمینه ا ی رابط از طریق نرم افزارهای آنلاین و با در نظرگرفتن کدون های نادر ،برای میزبان E. coli بهینه سازی شد .توالی رمز کننده این رابط روی پرایمر پایین دست ژن اپسیلون و پرایمر بالادست ژن بتا تعبیهگردید. سپس ساختمان دقیق فیوژن ژن و ساختمان های دوم و سوم فیوژن پروتئین و ویژگی های آن با استفاده از نرم افزار های بیوانفورماتیک مطالعه وتعیین گردید. نتایج نشان دادند که فیوژن ژن طراحی شده از ساختار مناسبی برای بیان فیوژن پروتئین مورد نظر برخوردار است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رضا پیله چیان لنگرودی
موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی بخش تحقیق و تولید واکسن های بی هوازی
خسرو آقائی پور
موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی بخش ژنومیک و مهندسی ژنتیک
مهدی شمس آرا
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک زیست فناوری