به کارگیری الگوریتم های بیو انفورماتیک در طبقه بندی سلولازهای میکروبی بر اساس محتوای پروتئینی

سلولز فراوان ترین منبع زیستی تجدید پذیر روی زمین است که بیش از 54 درصد وزن چوب خشک را تشکیل داده و پلیمری خطی متشکل از زیرواحدهایدی-گلوکز می باشد که با پیوندهای بتا 1 و 4 دی گلیکوزیدی به هم متصل هستند. سلولز نسبت به تجزیه بسیار مقاوم م یباشد، لذا هیدرولیز آنزیمی آنبسیار در صنعت اهمیت بالایی دارد. آنزیم های تجزیه کننده سلولز به طور کلی تحت نام عمومی سلولاز نامیده میشوند. سلولازها، انواع متعددی داشته و بهسه گروه اصلی اندوگلوکوناز، اگزوگلوکوناز و سلوبیوهیدرولاز تقیسم می شوند. طبقه بندی ذکر شده سلولاز را بر اساس ویژگی های شیمیایی و مکانیسمشکست گروه بندی می کند. در این مقاله ما طبقه بندی بر اساس محتوای اسید آمینه را ارائه می کنیم. به منظور تعیین ویژگی های تعیین کننده مهم هرنوع پروتئین، مدل های وزن دهی و درخت تصمیم گیری بر دیتا بیسی حاوی 296 توالی پروتئینی حاوی میکروارگانیسم های مختلف اجرا گردید. 894 ویژگی برای هر توالی محاسبه گردید. در این پژوهش برای اولین بار اسید آمینه سیستئین (تنها یا متصل به سایر آمینو اسیدها) نقش مهمی در طبقه بندیآنزیم سلولاز گزارش گردید. تعداد اسید آمینه سیتئین و دی پپتید سیستئین – آسپارژین بعنوان فاکتور مهم در 100% از مدل ها و تداد دی پپتیدسیستئین – آلانین در 80% از مدلهای وزن دهی مهم نشان داده شدند. نتایج الگوریتم های تصمیم گیری نیز همین نتایج را تایید کرد.

کلیدواژه ها:

سلولاز ، مدل های وزن دهی ، درخت تصمیم گیری ، بیوانفورماتیک