بررسی و مقایسه پرکاربرد ترین برنامه های نرم افزاری، برای تجزیه داده های حاصل از نشانگرهای مولکولی در جهت بررسی تنوع ژنتیکی

یکی از یافتههای مهم طی چند دهه گذشته در زمینه اصلاح نباتات، شناخت سرمایه عظیم تنوع ژنتیکی در گیاهان بوده است، تجزیه روابط ژنتیکی در گون ه-های زراعی یکی از مهمترین بخشهای برنامههای اصلاحی است. نشانگرهای مولکولی یک ابزار دقیق و کارآمد برای برآورد تنوع ژنتیکی بین و درونجمعیتهای گونه هستند و امروزه به طور گستردهای برای تشریح روابط ژنتیکی و تکامل بین گونهها و جمعیتها و مطالعه عدم تعادل لینکاژی استفاده م ی-شود. در بررسی تنوع ژنتیکی داده های بسیار زیادی وجود دارد که باید مورد دست ورزی قرار بگیرد، در نتیجه اگر تجزیه و تحلیل این برنامهها بدون برنامههای نرمافزاری صورت گیرد باعث اشتباهاتی بالطبع میشود. امروزه بکارگیری نرمافزارهای مختلف کامپیوتری در این خصوص، امکان تجزیه وتحلیل سریع ودقیق دادههای مورد نظر را فراهم نموده است. برنامههای نرم افزاری زیادی برای تجزیه دادههای حاصل از نشانگرهای مولکولی ارائه شده است که در عینشباهت در کارکرد تفاوتهای مهم و کلیدی باهم دارن د. در این مقاله به مقایسه و بررسی 5 نرم افزارArlequin ،GenALEX ،POPGENE ،GDA ، Power Marker پرداخته میشود. نتایج حاصل نشان داد که نرم افزای نیست که تمام پارامتر ها را محاسبه کند و محققین ناگریز هستند که از چند تا ازاین نرم افزار ها جهت تجزیه و تحلیل دادههای خود استفاده کند، اما به طور کلی نرم افزار GenAlex به علت سهولت کار ب ا آن، پشتیبانی از تمام فرمت-های دادهها برای بررسی تنوع ژنتیکی، محاسبات آماری ماتریس فاصله جغرافیایی، تجزیه به مولفههای اصلی، خود همبستگی، امکان انتقال داد ههای حاصلبه نرمافزارهای آماری دیگر و امکانات گرافیکی بسیار مناسب آن از سایر نرم افزارها کارایی بیشتری دارد.

کلیدواژه ها:

تنوع ژنتیکی ، نرمافزار ، نشانگرهای مولکولی ، GenAlex